Newsletter Spectra Diagnostic N°28
BIOLOGIE MOLECULAIRE
Le Machine Learning dans le DIV des maladies infectieuses
Dendris utilise un algorithme d’apprentissage automatique pour délivrer les résultats des échantillons cliniques analysés. A partir d’une base d’apprentissage constituée d’échantillons étiquetés (supervisés) l’algorithme va construire son modèle. De ce modèle il va pouvoir fournir des prédictions sur de nouveaux échantillons de façon automatique, fiable et rapide.
L’algorithme choisi par Dendris est basé sur la combinaison d’arbres de décisions. Cet algorithme appelé Random Forest a été proposé en 2001 par Leo Breiman, membre de l’académie des sciences aux USA. Ce programme est très utilisé en Intelligence Artificielle (IA) pour résoudre des problèmes de prédiction notamment dans le domaine de la santé (1832 citations sur PubMed en 2022).
Dès la création de Dendris, les équipes ont adapté et paramétré le Random Forest afin d’exploiter au mieux les données générées par la biopuce DendrisCHIP.
Le machine learning sans cesse amélioré permet aujourd’hui de répondre au mieux aux attentes des laboratoires par une sensibilité et une spécificité de détection des pathogènes optimales.
Les échantillons passés sur l’application enrichissent la base d’apprentissage permettant au modèle de devenir de plus en plus performant et d’élargir les panels avec de nouvelles cibles.
L’application et les données sont hébergées sur des serveurs (dual site) certifiés hébergeur de données santé (HDS). Enfin, la certification HDS garantit la sécurité par un cryptage des données et une politique de confidentialité stricte.
IMMUNO-ANALYSE
Analyseur d’immunodosage sans maintenance quotidienne
Beckman Coulter a dévoilé l’analyseur d’immunodosage DxI 9000 Access, l’analyseur d’immunodosage le plus productif par rapport à son encombrement : jusqu’à 215 tests par heure et par mètre carré (tests/h/m2), soit 450 tests par heure. Ce nouveau système renforce les performances du laboratoire grâce aux éléments suivants : une nouvelle technologie de détection et de traitement des analytes, des capteurs de précision, des algorithmes intelligents, une surveillance du système en temps réel et à distance.
Ce dispositif répond aux exigences actuelles en matière de rapidité, de fiabilité, de reproductibilité, de qualité et d’extension du menu. La plateforme a été vérifiée de manière indépendante par rapport au niveau de fonctionnement optimal de l’European Federation of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (EFLM), tandis que le nouveau substrat Lumi-Phos PRO a démontré sa capacité à produire des dosages de plus en plus sensibles et pertinents sur le plan clinique.
Selon Julie Sawyer Montgomery, présidente de Beckman Coulter Diagnostics : « Les employés du laboratoire apprécieront le gain de temps réalisé grâce à la maintenance ZeroDaily, mais aussi la technologie PrecisionVision qui évite les rapports de données erronées et IntelliServe qui optimise le temps opérationnel du système. Dans le même temps, les chercheurs cliniques sont ravis par la capacité de l’analyseur DxI 9000 à répondre aux exigences croissantes en matière de sensibilité des tests, alors que les professionnels de la santé et les sociétés pharmaceutiques s’attaquent à des maladies toujours plus complexes. »
La maintenance ZeroDaily élimine toute exigence de maintenance quotidienne, réduisant ainsi jusqu’à 96 % les routines de maintenance annuelles. La technologie PrecisionVision permet d’inspecter, identifier et prévenir les rapports erronés de résultats en temps réel. Ses dispositifs de sécurité intégrés et automatisés incluent notamment l’identification des tubes, la détection des bouchons, la vérification des embouts de pipetage, l’aspiration et la distribution des échantillons, le volume de lavage résiduel et le volume de substrat.
Ces analyseurs sont également connectables à la nouvelle solution de diagnostic et d’assistance à distance de Beckman Coulter, DxS IntelliServe, pour une assistance proactive et rapide en cas de besoin.
Disponible sur l’appareil, le dosage Access NT-proBNP fournit, en moins de 11 minutes, des résultats précis grâce à des seuils basés sur l’âge et des données de comorbidité spécifiques à la maladie, pour une meilleure interprétation des résultats.
HEMATOLOGIE
Nouvelle bibliothèque de variants d’hémoglobine pour l’interprétation des HPLC
Tosoh Bioscience – Diagnostics EMEA, pionnier dans le suivi du diabète et le diagnostic des hémoglobinopathies, a présenté sa nouvelle bibliothèque de variants de l’hémoglobine.
Cette bibliothèque innovante vise à soutenir les biologistes et les techniciens en tirant parti de l’expérience et de l’expertise de la communauté scientifique mondiale.
Elle offre la possibilité de :
• comparer des cas complexes avec des centaines de références de variants d’hémoglobine,
• devenir un membre actif de la communauté mondiale des laboratoires cliniques spécialisés en hémoglobinopathie et en diabète,
• explorer et partager des connaissances et des compétences.
Avec plus de 140 variants d’hémoglobine répertoriés, cette bibliothèque offre un affichage contextuel simplifié de chaque mutation sélectionnée. Il est désormais possible d’effectuer une recherche précise en sélectionnant :
• le type spécifique (alpha, bêta, delta, etc.)
• la fenêtre de migration
• le temps de rétention, etc.
De nouvelles fonctionnalités avancées ont également été introduites, telles que l’anamnèse et les données hématologiques pour une compréhension plus approfondie de chaque patient.
Pour garantir la sécurité, un accès protégé par mot de passe a été mis en place, et tous les résultats peuvent être facilement téléchargés au format PDF.
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Prescription connectée et serveur de résultats externe
Pour mieux répondre aux besoins du marché, Inlog étoffe son offre logicielle avec Labo en Line, solution de prescription connectée intégrant le calcul automatique du tubage et la gestion du plan de prélèvement.
Cette solution full web offre de multiples avantages tels que :
• la gestion efficace des prescriptions sur toutes les disciplines et pour tous les laboratoires,
• la traçabilité complète depuis le prélèvement dans les services de soins à leur arrivée dans le laboratoire,
• la facilité de déploiement au sein de l’établissement de soins,
• la possibilité de consulter l’application depuis un PC ou tout appareil mobile (application téléchargeable depuis Google Play ou l’Apple store).
En complément de la prescription connectée, l’éditeur s’est doté d’un serveur de résultats externe rendant possible la consultation des résultats directement par le patient et le médecin, toutes disciplines confondues au sein de l’établissement de santé. Patients et médecins sont notifiés de la mise à disposition des résultats.
Ce module est compatible avec l’ensemble des solutions Inlog ou toute autre solution tierce dans le respect des normes et standards d’interopérabilité (HL7, IHE).
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Nouvelle génération de middleware pour optimiser les process
Data Innovations (DI) a lancé Instrument Manager™ 2023 (IM 2023), qui introduit un nouveau cadre d’application basé sur un navigateur web appelé DI Gateway. Ce nouveau cadre présente une interface conviviale avec des fonctionnalités conçues pour des flux de travail efficaces et optimisés axés sur les besoins de l’utilisateur.
La première application développée dans le cadre de DI Gateway, qui fait partie de IM 2023, s’appelle Test Properties.
Cette application offre aux administrateurs informatiques un processus plus efficace et plus simple pour configurer les gammes de référence cliniques et techniques :
• les administrateurs peuvent configurer une bibliothèque complète de gammes de référence de laboratoire utilisées par leur système d’information de laboratoire (LIS). Le nouveau flux de travail permet de gagner du temps en réduisant considérablement la nécessité de définir manuellement des règles complexes.
• Test Properties s’intègre au système d’autovérification d’Instrument Manager, qui signale les résultats de tests qui sortent des plages de référence normales. IM signale également les résultats de tests nécessitant des vérifications delta en fonction des résultats antérieurs d’un patient.
• Les administrateurs qui utilisent l’application peuvent également accroître la normalisation dans leur laboratoire en utilisant les mêmes plages de référence et les mêmes protocoles de signalisation et d’alerte que ceux utilisés par leur SIL. L’application propose des indicateurs de résultats anormaux prédéfinis conformes aux normes d’interopérabilité HL7 et HiTech.
IM 2023 comprend également une plateforme de données actualisée, InterSystems IRIS®, pour une cybersécurité et des performances améliorées. IM 2023 est compatible avec Windows 11, Windows Server 2019 et Windows Server 2022.
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Importation automatique des catalogues LCSD
Inlog a lancé en juillet 2023 la version V7.1.0 d’EdgeSuite. Cette version apporte de nouvelles fonctionnalités très attendues, dont l’importation automatique des catalogues LCSD (Laboratory Code Set Distribution).
L’intégration de cette fonctionnalité dans Edgelab est une avancée significative pour les laboratoires qui incorporeront automatiquement les catalogues de leurs sous-traitants au format HL7 IHE LCSD, simplifiant ainsi la gestion des codes et des conditions de prélèvement.
Cette fonctionnalité présente plusieurs avantages essentiels et offre ainsi :
• un gain de temps considérable sur la saisie manuelle des données,
• la garantie du niveau accru de sécurité dans le respect des normes de format HL7 IHE LCSD,
• le respect des exigences de confidentialité des laboratoires,
• la mise à jour en temps réel des données du catalogue (limitation du risque d’erreurs dues à la saisie manuelle, cohérence et exactitude des données).
La version 7.1.0 renforce l’efficacité opérationnelle des laboratoires et garantit des conditions de prélèvement optimales.
L’IGR, Roche, et Foundation Medicine étendent l’analyse génomique par biopsie liquide aux patients atteints de cancer en France
Roche, Foundation Medicine, Inc. et Gustave Roussy, premier centre de lutte contre le cancer en Europe, troisième mondial, se lancent dans un partenariat unique pour établir, à Gustave Roussy en France, au cœur du Grand Paris, une plateforme d’analyse de tests de biopsie liquide, en transférant la technologie de FoundationOne® Liquid CDx, un test de profilage génomique sanguin complet (CGP).
À l’aide d’un simple échantillon de sang, FoundationOne Liquid CDx analyse plus de 300 gènes liés au cancer pour rechercher les altérations génomiques qui provoquent la croissance de la maladie. L’identification des altérations génomiques du cancer d’un patient peut aider à poser un diagnostic plus rapidement et à orienter les stratégies de traitement pour le patient dans de multiples indications de cancer. Le CGP a transformé l’approche one-size fits-all des traitements du cancer, et constitue un outil important pour identifier les mutations rares et difficiles à trouver. La biopsie liquide permet à un plus grand nombre de patients atteints de cancer avancé de bénéficier des thérapies ciblées indiquées par le CGP, par exemple lorsqu’une biopsie tissulaire n’est pas possible ou recommandée, car la tumeur est inaccessible, lorsqu’il n’y a pas suffisamment de tissu ou lorsqu’elle est préférée par commodité pour le patient, ou pour des raisons de délai. La biopsie liquide est indiquée dans l’ensemble des recommandations de prise en charge des patients vivant avec un cancer.
Dans le cadre de ce partenariat public-privé, Gustave Roussy augmentera ses capacités en biopathologie en créant un laboratoire innovant d’analyses génomiques qui sera accessible à des experts reconnus, centres et institutions de médecine de précision de référence en France. Les médecins français auront accès à un diagnostic plus précis de leurs patients afin d’identifier les options thérapeutiques potentielles, favorisant le développement de nouveaux essais cliniques qui viendront soutenir la recherche et le développement.
« Cette future plateforme d’analyse stratégique de biopsies liquides adossée à la création d’une base de données clinico-génomiques soutient les avancées déjà rendues possibles par l’INCa puis le plan France Médecine Génomique 2025 », a déclaré le Pr Fabrice Barlesi, Directeur Général de Gustave Roussy. « Jusqu’à 200 000 patients ont besoin d’un profil génomique chaque année en France, y compris dans des zones géographiques où l’accès y est plus difficile. Ce partenariat pourrait permettre à des dizaines de milliers de patients de bénéficier de cette technologie de diagnostic, et d’accéder à des traitements anticancéreux adaptés aux anomalies moléculaires actionnables, ainsi qu’à un plus grand nombre d’essais cliniques, en particulier dans les phases précoces. C’est une meilleure équité d’accès à la médecine de précision ».
« La biopsie liquide est une révolution diagnostique qui, selon nous, va améliorer la qualité de vie et les résultats pour de nombreuses personnes atteintes de cancer » a déclaré Jean-François Brochard, Président de Roche Pharma France.
Gustave Roussy
Foundation Medicine
Roche
Inlog obtient ses certificats ISO 13485:2016 et CE versus le règlement 2017/745
Inlog conçoit ses solutions logicielles afin qu’elles apportent une réelle plus-value pour ses clients, tant organisationnelle que dans l’aide aux diagnostics et aux traitements des patients pris en charge. En tant que dispositifs médicaux, leur développement, distribution, installations et services sont encadrés par le règlement RDM 2017/745 pour le marché européen. Ce règlement, venu renforcer les exigences en mai 2022, assure aux utilisateurs et aux patients que les dispositifs médicaux marqués CE sont plus sûrs et permettent l’atteinte des bénéfices cliniques revendiqués par les fabricants. Inlog a annoncé l’obtention de ses certificats EN ISO 13485 : 2016 et CE versus le règlement 2017/745 ainsi que le marquage CE de sa nouvelle version 7.1.0.
Inlog renforce ainsi sa position en tant qu’éditeur de logiciels médicaux fiables et sécurisés, répondant aux normes les plus élevées de l’industrie.
Double objectif pour les LBM : accréditation de leur portée d’accréditation et transition à la norme NF EN ISO 15189 révision 2022
Début septembre, 629 laboratoires de biologie médicale (LBM) étaient accrédités selon la norme NF EN ISO 15189 révision 2012 au moins sur une partie de leur activité, avec pour tous l’obligation d’être accrédités sur la totalité de cette activité. Certains laboratoires peuvent être accrédités sur plus de 100 lignes de portée générale qui reflètent leurs compétences (incluant des lignes de portée identiques sur plusieurs sites), ce qui peut représenter plus de 1000 examens couverts par l’accréditation.
Depuis la publication de la nouvelle révision de la norme ISO 15189 en décembre 2022, les LBM doivent également intégrer les nouvelles exigences dans leur système de management. Cette révision s’inscrit dans une dynamique d’évolution en mettant davantage l’accent sur la prise en charge des patients, par la planification et la mise en œuvre d’actions visant à gérer les risques, pour un service médical rendu adapté.
Une période de transition de 3 ans à partir de la date de publication de la norme a été fixée au niveau international. Les évaluations des LBM selon cette nouvelle norme démarreront en octobre 2023 en fonction de la période de leurs évaluations de surveillance. Plus de 80 évaluations de transition sont prévues d’ici fin 2023. Tous les LBM devront être accrédités selon cette nouvelle norme avant la fin de la période de transition, soit décembre 2025.
Philippe Besset, nouveau Président des Libéraux de santé
Le Bureau des Libéraux de santé* s’est réuni le 12 septembre en marge de son événement de rentrée « Repenser le pacte conventionnel pour garantir le pacte social de l’accès aux soins ». Philippe Besset, pharmacien d’officine et président du syndicat FSPF, a été élu à l’unanimité en tant que nouveau Président des LDS. Il succède ainsi au Président fraichement élu de l’Union nationale des professions de santé (UNPS), Sébastien Guérard (FFMKR).
Le nouveau Bureau des Libéraux de santé
• Président : Philippe Besset (FSPF)
• 1e vice-Présidente : Sarah Degiovani (FNO)
• Secrétaire générale : Catherine Mojaïsky (Les CDF)
• Trésorière générale : Pascale Lejeune (FNI)
• Vice-présidents : François Blanchecotte (SDBIO), David Boudet (FNP), Franck Devulder (CSMF), Pierre-Olivier Donnat (Les CDF), Luis Godinho (SDA), Sébastien Guérard (FFMKR), Daniel Guillerm (FNI), Mélanie Ordines (SNAO).
Le mandat confié au nouveau Bureau des Libéraux de santé s’inscrit dans la continuité du précédent et autour des 7 axes qui constituent la feuille de route des LDS : rénover le système conventionnel, construire et animer la coordination de proximité, transformer les métiers, décloisonner la prévention, améliorer la dispense d’avance de frais, décarboner les soins de ville, garantir la sécurité des libéraux de santé.
L’essence même de la création des Libéraux de santé en 2022, était une volonté commune des organisations, de défendre des positions volontaristes en faveur de l’exercice libéral. C’est pourquoi les LDS, qui constituent une majorité au sein du bureau de l’UNPS, se rangent naturellement derrière les ambitions de la nouvelle équipe de l’UNPS et appuieront cette politique, avec une volonté forte de faire bouger les lignes et de reconstruire un dialogue équilibré avec les pouvoirs publics.
Les LDS soutiendront pleinement le projet de modernisation du système conventionnel et de révision en profondeur de l’Accord cadre interprofessionnel (ACIP), engagé par l’UNPS. Ils ont présenté des propositions fortes pour atteindre cet objectif aux deux ministres du champ de la santé, Aurélien Rousseau et Agnès Firmin le Bodo, et au directeur général de la Cnam Thomas Fatome. Conforter le système conventionnel et le rénover faisait également partie des propositions, du projet de loi de santé co-écrit par ces 10 syndicats représentatifs des LDS.
« La confiance entre les professionnels libéraux de santé et les Pouvoirs publics, aujourd’hui fragilisée par des années de pression économique sur les soins de ville et le contournement des syndicats représentatifs dans les concertations et les décisions, doit être rétablie. Les LDS poursuivront par ailleurs leurs travaux relatifs à l’évolution des contours des métiers. Ils défendront aussi leurs propositions dans les grands dossiers de réforme en cours : mise en œuvre des rendez-vous de prévention, loi fin de vie, PLFSS… » annoncent-ils.
* Les Libéraux de Santé (LDS) regroupent les 10 principaux syndicats représentatifs de professionnels de santé libéraux : les CDF, la CSMF, la FFMKR, la FNI, la FNO, la FNP, la FSPF, le SDA, le SDBIO et le SNAO.
Une origine bactérienne à l’endométriose ?
Des chercheurs de l’université de Nagoya ont montré comment Fusobacterium pouvait jouer un rôle clé dans le développement de l’endométriose, la bactérie ayant été détectée chez plus de 60 % des femmes atteintes de cette maladie. Les résultats de l’étude sont encourageants et pourraient indiquer un rôle potentiel pour les antibiotiques dans le traitement de l’endométriose chez les femmes positives à l’infection par Fusobacteria.
Bien que l’endométriose touche près d’une femme sur dix, il faut en moyenne huit ans pour poser un diagnostic. L’une des principales raisons : les chercheurs ne comprennent pas encore totalement les mécanismes sous-jacents de la maladie et la manière exacte dont elle se produit. Cependant, des preuves de plus en plus nombreuses suggèrent que les bactéries pourraient jouer un rôle clé dans sa pathogenèse.
L’étude a montré que 64 % des patientes atteintes d’endométriose présentaient Fusobacterium dans leur muqueuse utérine, contre moins de 10 % des femmes du groupe témoin. Pour déterminer son effet direct sur l’endométriose, l’équipe a transplanté du tissu endométrial d’un groupe de souris dans la cavité abdominale d’un autre groupe et, en l’espace de quelques semaines, elle a constaté la présence de lésions endométriosiques chez les souris receveuses.
Après traitement des souris par antibiotiques, le métronidazole ou le chloramphénicol, administrés par voie vaginale, les chercheurs ont constaté que cela réduisait de manière significative le développement de l’endométriose, ainsi que le nombre et la taille des lésions.
Selon les auteurs, non seulement ces résultats donnent un aperçu important de la cause sous-jacente de l’endométriose, mais ils fournissent également une justification convaincante et nouvelle pour le ciblage de Fusobacterium en tant que traitement antibiotique non hormonal de l’endométriose. Cependant, bien que ces résultats soient intrigants et potentiellement prometteurs, la recherche dans ce domaine n’en est qu’à ses débuts. Des recherches plus approfondies chez l’Homme sont nécessaires pour mieux comprendre comment Fusobacterium pénètre dans l’organisme et provoque l’endométriose. Il sera également important pour les chercheurs de mieux comprendre si les antibiotiques ont un rôle à jouer dans le traitement de l’endométriose, notamment en raison de leurs effets secondaires lorsqu’ils sont utilisés à long terme.
MURAOKA A et al., Fusobacterium infection facilitates the development of endometriosis through the phenotypic transition of endometrial fibroblasts, Science Translational Medicine, 2023; 15(700) SDB, Syndicat des Biologistes
Une vision mondiale qui interroge le paradigme des résistances aux antibiotiques
Pour comprendre les principaux déterminants de la dynamique mondiale de la résistance aux antibiotiques, des scientifiques de l’Institut Pasteur, de l’Inserm et des universités de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et de Paris-Saclay ont développé un modèle statistique grâce à une analyse spatio-temporelle de grande ampleur. En utilisant la base de données de suivi de l’antibiorésistance ATLAS, ce modèle a mis en évidence des différences importantes de tendances et de facteurs associés en fonction des espèces de bactéries et des résistances à certains antibiotiques. Par exemple, la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif étudiées ; des températures élevées sont à l’inverse associées à des forts niveaux d’antibiorésistance chez les Entérobactéries. De façon inattendue, la consommation d’antibiotique nationale n’est pas corrélée à la résistance chez la majorité des bactéries testées. Ces résultats suggèrent que les mesures de contrôle de l’antibiorésistance doivent s’adapter au contexte local et aux combinaisons bactéries-antibiotiques ciblées.
RAHBE E et al., Determinants of worldwide antibiotic resistance dynamics across drug-bacterium pairs: a multivariable spatial-temporal analysis using ATLAS, The Lancet Planetary Health, 2023; 7(7):e547-e557
Une explication du Covid long chez les patients psychotiques par l’activation du rétrovirus HERV-W
GeNeuro, société biopharmaceutique développant des traitements pour les maladies neurodégénératives et auto-immunes, telles que la sclérose en plaques (SEP), la sclérose latérale amyotrophique (SLA) et les conséquences neuropsychiatriques sévères de COVID-19 (post-COVID ou COVID long), a publié, en collaboration avec le Pr Marion Leboyer, Directrice Générale de la Fondation FondaMental et le Dr Ryad Tamouza, immunologiste responsable du groupe immuno-psychiatrie, une étude montrant que plus de 80 % des patients hospitalisés pendant la première vague de la pandémie de COVID-19 dans un service de psychiatrie de la région parisienne avaient été exposés au SARS-COV-2 – soit 1,6 fois plus que dans le groupe contrôle.
27% des patients présentant une sérologie SARS-COV-2 positive (non vaccinale) correspondaient au sous-groupe de troubles psychotiques précédemment décrit et associé à l’expression de HERV-W. Ces résultats ont été rapprochés à ceux d’une étude récente montrant que le virus responsable de COVID-19 peut déclencher l’activation du rétrovirus HERV-W, ce qui peut entraîner des syndromes post-infectieux ou des maladies associées à l’expression persistante de HERV-W ENV chez des individus génétiquement prédisposés.
Plusieurs facteurs spécifiques expliquant la présence de COVID-19 asymptomatique ou non enregistrée chez ces patients hospitalisés dans le service de psychiatrie de l’hôpital universitaire Créteil-Paris VII en France ont également été suggérés.
Un traitement personnalisé déjà à l’étude
Les auteurs concluent que ce sous-groupe de «psychoses inflammatoires», déjà défini à plusieurs reprises, appelle au développement d’une approche thérapeutique différentielle dans les psychoses et plus spécifiquement à l’identification et au développement d’autres thérapies de médecine de précision liées aux HERV.
« Les résultats plaident fortement en faveur d’une stratégie de médecine de précision ciblant cette protéine HERV-W chez ces patients présentant des profils post-infectieux et immuno-inflammatoires », a déclaré le Professeur Marion Leboyer.
GeNeuro a initié un programme avec le temelimab, un anticorps dirigé contre HERV-W ENV : les premiers mois de l’essai ont déjà confirmé que la protéine W-ENV est présente dans le sang de plus de 25 % des patients atteints de syndromes persistants et souffrant de COVID long. En cas d’issue positive de l’essai clinique en cours, dont les résultats sont attendus au deuxième trimestre 2024, une approche de médecine personnalisée pourrait offrir une solution thérapeutique à un sous-ensemble important de millions de patients touchés par le COVID long.
« Cette étude ouvre la voie à l’identification de biomarqueurs permettant d’identifier des sous-groupes de patients au sein d’une entité nosologique cliniquement définie, qui pourront être traités efficacement par une approche thérapeutique pertinente et ciblée. Avec cette approche de médecine de précision, GeNeuro apporte une véritable innovation dans le traitement du COVID long avec un essai clinique de phase II en cours » a ajouté le Dr Hervé Perron, Directeur Scientifique de GeNeuro.
TAMOUZA R et al., Patients with psychosis spectrum disorders hospitalized during the COVID-19 pandemic unravel overlooked SARS-CoV-2 past infection clustering with HERV-W ENV expression and chronic inflammation, Translational Psychiatry, 2023; 13:272
GeNeuro
MANIFESTATIONS
Retrouvez dans Spectra Diagnostic N°28 :
BOURSE & BIOTECHS
Grace à ces deux médicaments blockbusters, Novo Nordisk s’envole en Bourse
Arsia AMIR-ASLANI, Sam RASHIDI, Guillaume LEBEL
INTERVIEW
Ségur du Numérique : vers une Vague 1 bis pour la biologie ?
Dr Guilhem Mayoral, Président et Directeur Médical d’Onaos
FOCUS
Perturbateurs endocriniens et cancer de la prostate
Charlotte HINAULT-BOYER
MISE À JOUR DES CONNAISSANCES
Les biomarqueurs dans la surveillance active du cancer de la prostate
Groupe de Biologie Spécialisée de la SFMN
CAS BIOCLINIQUES
Des taux de protéine C réactive et de procalcitonine sériques déroutants !
Doha EL BEKKAOUI, Fatima KELI, Aissam EL MAATAOUI
MISE À JOUR DES CONNAISSANCES
Quand et comment dépister les dysfonctions thyroïdiennes durant la grossesse ?
Safouane HAMDI, Khaldoun GHAZAL, Valérie MOAL, Anne-Sophie GAUCHEZ
CAS BIOCLINIQUES
Trichinellose : à propos d’un cas d’infestation importée par correspondance
Patrice BOUREE, Yagoob GAREDAGHI, Francine BISARO
Newsletter Spectra Diagnostic N°27
ANALYSEURS
Nouvel instrument de dépistage néonatal de l’hémoglobine
Sebia CAPILLARYS 3 DBS est la dernière génération d’instrument dédié au dépistage de l’hémoglobine chez le nouveau-né, offrant un flux de travail fluide et d’excellentes caractéristiques analytiques. Il permet une traçabilité complète des échantillons, de leur collecte à l’obtention du résultat.
Il assure le dépistage des hémoglobinopathies chez le nouveau-né.
La haute résolution de l’électrophorèse capillaire, couplée aux performances excellentes de l’instrument CAPILLARYS 3 DBS, permet une visualisation simple et rapide de l’hémoglobine Bart ce qui simplifie l’interprétation et le rendu des résultats.
Les bénéfices de l’instrument :
• Haute cadence analytique : 70 échantillons/h
• Grande capacité de chargement : jusqu’à 8 microplaques de 96 puits installées à bord
• Traçabilité complète de l’échantillon du poinçonnement jusqu’au résultat
• Traçabilité et gestion automatisée des réactifs embarqués par puces RFID
• Excellente résolution
• Identification automatique présomptive des profils.
ANALYSEURS
Système d’immuno-analyses complet et compact
Tosoh ouvre de nouvelles perspectives pour la réalisation des immuno-analyses avec le lancement de son nouvel automate : l’AIA®-CL300. Ce système très compact, « The Small Giant », offre de hautes fonctionnalités pour répondre à des besoins spécifiques et améliorer l’efficacité des laboratoires.
Ce système hérite de la haute technologie de la gamme AIA®-CL de Tosoh, reconnue pour sa fiabilité, sa simplicité d’utilisation et ses performances analytiques remarquables. L’association de la chimiluminescence et du test unitaire breveté Tosoh avec une réaction en deux étapes, offre des limites de détection, de sensibilité et de stabilité inégalées, sans aucune interférence avec la biotine ou les Ac anti-streptavidine.
Voici quelques exemples des performances de l’AIA®-CL300 :
• Limite de détection de la Troponine I : 1,61 pg/mL avec un coefficient de variation de 10 % à 5,55 pg/mL
• Limite de détection du PSA : 0,0011 ng/mL
• Sensibilité fonctionnelle de la TSH (avec un coefficient de variation de 20 %) : 0,023 μUI/mL
Les différents tests sont réalisés simultanément, et ce, en seulement 15 minutes, à l’exception de la Vitamine D (35 minutes) et de la B12 et des Folates (25 minutes).
De plus, cet appareil est conçu pour produire des résultats fiables 24 heures sur 24, 7 jours sur 7, avec un minimum de manipulation grâce à une interface intuitive et à des opérations de maintenance simples et limitées. Le relissage de la calibration usine est stable pendant 90 jours pour tous les tests, et les dilutions et prétraitements se font automatiquement. Chaque cupule (twin cup) est équipée d’un code QR® pour une identification et une traçabilité parfaite de tous les réactifs. Chaque test unitaire lyophilisé est automatiquement reconstitué à bord de l’automate au moment du prélèvement de l’échantillon.
Des tests de routine aux pathologies spécifiques en passant par les cas d’urgence, cet automate puissant est parfait pour les laboratoires en constante évolution qui cherchent à améliorer leur efficacité et leur précision.
EQUIPEMENT DE LABORATOIRE
Nouvelle seringue à gaz du sang par aspiration
La société Radiometer propose la safePICO A : cette seringue vient compléter la gamme safePICO destinée à minimiser les erreurs préanalytiques afin d’obtenir des résultats de gaz du sang fiables :
• La bille d’agitation intégrée et l’agitation automatique améliorent la qualité d’analyse grâce à un mélange standardisé couplé avec les séries ABL90 et ABL800 FLEX, sans provoquer d’hémolyse.
• Grâce à l’homogénéisation standardisée, les résultats de tHb sont précis et stables pendant 30 minutes.
• L’héparine sèche et équilibrée en électrolytes, conçue de manière unique, réduit le risque de caillots, de biais sur les électrolytes et de dilution de l’échantillon.
Elle apporte également une évolution en terme d’épargne sanguine ainsi que dans la recherche d’une sécurité optimale de l’utilisateur en réduisant le risque d’AES :
• Le bouchon safeTIPCAP ventilé permet d’évacuer les bulles d’air, de sceller l’échantillon immédiatement après le prélèvement, de réduire le risque de contact avec le sang du patient, depuis le prélèvement jusqu’à l’analyse, lorsqu’il est utilisé couplé avec les analyseurs ABL.
• L’arrêt du piston, fonction de protection qui permet d’assurer son maintien dans le corps de la seringue en empêchant toute exposition accidentelle au sang.
• La marque 0,7 mL affiche clairement la quantité minimale de sang nécessaire pour mesurer tous les paramètres disponibles sur les analyseurs à gaz du sang Radiometer.
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Nouvelle version pour l’importation automatique des catalogues LCSD
Inlog lance en juillet 2023 la version V7.1.0 d’EdgeSuite. Cette version apporte de nouvelles fonctionnalités très attendues, dont l’importation automatique des catalogues LCSD (Laboratory Code Set Distribution).
L’intégration de cette fonctionnalité dans Edgelab est une avancée significative pour les laboratoires qui pourront intégrer automatiquement les catalogues de leurs sous-traitants au format HL7 IHE LCSD, simplifiant ainsi la gestion des codes et des conditions de prélèvement.
Cette fonctionnalité présente plusieurs avantages essentiels, et offre ainsi :
• un gain de temps considérable sur la saisie manuelle des données,
• la garantie du niveau accru de sécurité dans le respect des normes de format HL7 IHE LCSD,
• le respect des exigences de confidentialité des laboratoires,
• la mise à jour en temps réel des données du catalogue (limitation du risque d’erreurs dues à la saisie manuelle, cohérence et exactitude des données).
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Nouvelle suite informatique complète
Dedalus Group, fournisseur de solutions logicielles pour les soins de santé et le diagnostic en Europe, a lancé sa suite InVitro premium et globale à EuroMedLab – WorldLab 2023, dans le cadre de sa stratégie d’expansion internationale.
Véritable pilier, la Suite InVitro porte les derniers systèmes d’information de laboratoire, d’anatomopathologie et de génétique à un niveau mondial. Grâce à une précision accrue, à une obtention plus rapide des résultats, à une médecine plus individualisée et à une collaboration plus fluide, cette suite complète doit accompagner efficacement les professionnels de santé afin d’obtenir des résultats de qualité supérieure pour les patients.
Selon Marlen Suller, directrice de la Business Unit In Vitro Diagnostics de Dedalus. « Il s’agit d’un moment décisif pour Dedalus, qui élargit ainsi son offre pour de nouveaux pays et de nouveaux marchés. Nous sommes convaincus que notre nouvelle marque nous permettra de mieux accompagner nos clients, de nous saisir de nouvelles opportunités et de stimuler une croissance durable au niveau international. »
Cette suite logicielle est conçue pour répondre aux besoins d’interopérabilité et d’échange de données, afin de constituer un ensemble de solutions à la hauteur des exigences d’un environnement moderne de diagnostic médical.
Le portefeuille en IVD de Dedalus, référence sur le marché européen, offre une gamme complète de solutions de pathologie clinique, de pathologie anatomique, de pathologie numérique et de génétique, ainsi que des logiciels de compte rendus, de management de la qualité et de middleware, permettant des diagnostics efficaces dans plus de 5700 laboratoires à travers le monde.
Inlog renforce son pôle Qualité avec les acquisitions de Viskali et Ubilab
En mai, le groupe Inlog, dirigé par D. Kalfon, réalise à la suite 2 opérations de croissance externe devenant ainsi un leader dans le management de qualité pour les laboratoires de biologie médicale.
Les acquisitions des sociétés Viskali et Ubilab viennent compléter son offre Sapanet. Au-delà des 3 millions d’euros de revenus récurrents additionnels pour Inlog, ces 2 éditeurs lyonnais jouissant d’une forte réputation apportent leur expertise via des modules complémentaires en web : manuel de prélèvement, serveur de résultats, etc. Cet apport permet désormais à Inlog de proposer une offre très large à ses clients tant publics que privés. Les équipes dirigeantes de Viskali et Ubilab participent activement aux prochaines étapes du développement et réinvestissent au niveau du groupe.
Abénex, actionnaire majoritaire qui avait organisé la sortie d’Inlog du groupe américain Haemonetics, soutient activement ces deux opérations.
« Il était important de renforcer le pôle Qualité d’Inlog. Nous sommes très heureux d’accueillir les équipes de Viskali et Ubilab qui viennent enrichir nos compétences techniques et confirmer la position d’Inlog par la complémentarité de leur clientèle, notamment dans le secteur privé » commente David Kalfon, Président du Groupe Inlog.
Patrick Vallet et Christophe Dubernet de Bosq, respectivement co-fondateurs de Viskali et d’Ubilab, ajoutent : « Nous sommes ravis de rejoindre le Groupe Inlog aux côtés d’Abénex pour poursuivre la croissance engagée et mettre à disposition notre savoir-faire sur le métier de la qualité. »
Le groupe Inlog compte désormais environ 70 collaborateurs et génère environ 12 millions d’euros de CA à travers les BU Sang, Laboratoire et Qualité, soit un quasi doublement de taille depuis l’entrée d’Abénex en septembre 2020.
Ségur V1-V2
Parallèlement à ces fusions, et après le passage avec succès en vague 1 de la majorité de ses clients, Inlog premier éditeur certifié Ségur V1, travaille aujourd’hui en étroite collaboration avec l’ANS, la DNS et un consortium d’éditeurs afin de délimiter le périmètre de la vague 2.
Cette deuxième vague ambitionne notamment d’améliorer l’accès à l’information médicale, la sécurité des logiciels et les usages clés.
bioMérieux : nouvelle gouvernance à deux têtes
bioMérieux fait évoluer sa gouvernance. Depuis le 1er juillet 2023, Alexandre Mérieux est devenu Président Exécutif, et Pierre Boulud a été nommé Directeur Général.
Sur proposition d’Alexandre Mérieux, PDG, le Conseil d’administration (CA) de bioMérieux a validé ces deux nominations. Pierre Boulud est membre du Comité de Direction depuis sept ans dont trois en tant que DG Délégué.
Avec cette évolution de gouvernance, qui dissocie les fonctions de Président et de Directeur Général, Pierre Boulud dirigera le Comité de Direction de bioMérieux pour mettre en œuvre la stratégie de l’entreprise dans toutes ses dimensions.
Face aux fortes évolutions du secteur mondial de la santé, Alexandre Mérieux se concentrera ainsi sur les enjeux essentiels de stratégie générale. En tant que Président Exécutif avec des pouvoirs étendus, il continuera d’assurer la présidence du CA dont la mission est notamment de définir et de valider la stratégie du Groupe. En collaboration avec Pierre Boulud, il participera en outre à la définition des orientations en matière de Responsabilité Sociale et Environnementale et d’innovation ainsi qu’au recrutement des principaux cadres dirigeants.
Alexandre Mérieux a commenté : « Après avoir assuré pendant neuf ans le rôle de Directeur Général de bioMérieux, je suis heureux de voir Pierre Boulud me succéder à cette fonction. Pierre a fortement contribué au développement de la société depuis sept ans et a toute ma confiance pour conduire les équipes et renforcer le rôle de leader de bioMérieux dans le diagnostic des maladies infectieuses. Je me réjouis de poursuivre notre étroite collaboration dans la conduite de bioMérieux. »
Pierre Boulud a déclaré : « Je suis très honoré de la confiance que me témoignent Alexandre Mérieux et le Conseil d’administration de bioMérieux et enthousiaste à l’idée de mener plus loin encore l’engagement mondial de l’entreprise et de tous ses collaborateurs dans notre mission commune de santé publique ».
Ayant rejoint bioMérieux en 2005, Alexandre Mérieux devient DG, avant d’être nommé PDG par le CA fin 2017. Il est par ailleurs Vice-Président de l’Institut Mérieux depuis décembre 2008 et Président du CA de Mérieux NutriSciences (société spécialisée dans la sécurité et la qualité des aliments, détenue à 70 % par l’Institut Mérieux) depuis septembre 2013.
De son côté, après un parcours au Boston Consulting Group puis chez Ipsen, Pierre Boulud a intégré bioMérieux en novembre 2016, comme membre du Comité de Direction en charge de la Région Asie-Pacifique. En mars 2020, il prend la Direction des Opérations Cliniques et est nommé DG Délégué de bioMérieux.
Pierre Boulud est par ailleurs membre du CA de MedTech Europe.
M2care, la filiale de Mérieux Développement qui soutient l’entreprenariat HealthTech
M2care, acteur de l’innovation des technologies de la santé, dévoile sa nouvelle stratégie de venture studio pour détecter des projets technologiques de startups innovantes et financer les tous premiers stades de leur développement. Fondé en 2017 à l’initiative de Mérieux Développement, filiale de l’Institut Mérieux spécialisée dans l’investissement en santé, M2care a l’ambition de renforcer l’innovation technologique en santé au niveau européen.
Après s’être déployé lors de sa création autour d’un modèle d’accélérateur et de services aux entreprises de la santé, M2care évolue pour adopter un modèle de venture studio. Sa mission consiste désormais à accompagner très en amont, et à financer, les tous premiers stades de startups de la HealthTech travaillant sur des solutions innovantes pour le secteur médical (dispositifs médicaux, outils diagnostiques, outils de santé numériques).
M2care compte parmi ses actionnaires de référence l’Institut Mérieux, le CEA Investissement et UI Investissement.
Une feuille de route ambitieuse et une première réalisation
Pour assumer ses ambitions, la venture a ouvert une levée de fonds de 25 millions d’euros et prévoit de créer deux startups par an sur les cinq prochaines années. En octobre 2022, M2care a réalisé son premier investissement dans un projet au stade d’amorçage : les fondateurs de cette société française ont bénéficié de l’appui de M2care sur toutes les phases du développement de leur projet d’application basée sur l’IA pour le diagnostic précoce du sepsis.
En plus de l’accompagnement, ce nouvel acteur contribue à leur financement en prenant des parts en capital, à travers son véhicule d’investissement « V4Health ».
Chaque année, l’équipe source et analyse près de 400 projets pour ensuite effectuer une sélection drastique en analysant de nombreux critères (scientifiques, technologiques, industriels, règlementaires et commerciaux). Après un accompagnement étroit des startups sur les premières étapes de structuration, M2care recrute progressivement une équipe sur-mesure pour suivre les développements au long cours, et mener les projets jusqu’à leur mise sur le marché.
Pour ce faire, M2care peut s’appuyer sur son vaste réseau et sa connaissance de l’écosystème européen et de la recherche en santé (experts, académiques, hôpitaux, fonds de capital-risque, grands groupes industriels, etc.). Ainsi, il est capable d’identifier des projets à potentiel, d’anticiper les défis et de réduire en amont les risques potentiels : définition de la stratégie et du business développement, design du protocole d’étude clinique, anticipation des contraintes règlementaires, aspects de propriété intellectuelle, etc.
« Nous sommes des entrepreneurs expérimentés à l’écoute d’entrepreneurs en devenir, » explique Florence Thueux, Présidente Directrice Générale de M2care. « Notre expertise unique s’appuie sur des compétences pluridisciplinaires et une excellente connaissance des réseaux en santé qui peuvent soutenir, aider, et encourager ces porteurs de nouvelles innovations technologiques. Nous intervenons à chaque étape de structuration de leur projet pour faire éclore et grandir les idées les plus prometteuses pour l’avenir de la santé ».
Validation scientifique de Ziwig Endotest® comme outil diagnostique de l’endométriose
Ziwig, biotech française, précurseur dans l’analyse de l’ARN salivaire, a vu son Ziwig Endotest® validé comme outil diagnostique pour l’endométriose, par une étude publiée dans la prestigieuse revue scientifique du New England Journal of Medicine (1).
Les résultats publiés confirment la performance et la reproductibilité de ce test, avec une sensibilité et une spécificité supérieures à 95 %, ce qui en fait le seul outil diagnostique non invasif dont l’efficacité est incontestable et qui constitue une alternative à la chirurgie. Il s’agit d’« une révolution dans le diagnostic, aux perspectives formidables pour les patientes » a déclaré le professeur Horace Roman, fondateur de l’IfemEndo Bordeaux.
En outre, la démonstration par cette étude de l’efficacité de la combinaison du séquençage de nouvelle génération et de l’Intelligence Artificielle (IA) annonce l’avènement prochain de nouveaux outils non invasifs permettant de prédire la réponse aux traitements, de définir les différents phénotypes biologiques de la maladie, et d’améliorer l’efficacité du triage diagnostique par imagerie.
« Faire le diagnostic précoce de l’endométriose permet d’identifier cette cause d’infertilité et d’adapter rapidement la prise en charge » souligne le professeur Samir Hamamah, auteur du premier rapport sur les causes d’infertilité (2) commandé par le Ministère de la Santé, chef du Service de biologie de la reproduction au CHU de Montpellier.
Ziwig Endotest® est actuellement disponible en Suisse, au Royaume-Uni, en Italie, Allemagne, Suède, Norvège, Danemark, Islande, Lithuanie, Lettonie, Estonie, Arabie Saoudite, Émirats Arabes Unis. Il le sera très prochainement en Hongrie, en Belgique, au Luxembourg, au Koweït, au Qatar et en Israël. Il est remboursé en Suisse.
En France, Ziwig travaille en étroite collaboration avec les autorités sanitaires pour rendre ce test disponible pour les professionnels de santé et les patientes avant la fin de l’année 2023.
« Il est grand temps qu’un outil révolutionnaire et simple d’utilisation soit enfin disponible pour les millions de femmes atteintes d’endométriose (…) afin de préserver leur fertilité et leur qualité de vie » rappelle Priscilla Saracco, Patiente Experte Endomind.
Le Syndicat des biologistes renouvelle ses instances
Les adhérents du Syndicat des biologistes (SDBIO) ont élu les membres du Conseil d’administration pour un mandat de trois ans. Le nouveau Conseil s’est réuni pour la première fois le mardi 13 juin afin de procéder à l’élection de son Président et du Bureau national.
• Le Dr François Blanchecotte a été reconduit à l’unanimité à la tête du syndicat pour un nouveau mandat de 3 ans.
• Le Bureau national est quant à lui composé, en plus du Président, de 20 membres, tous biologistes libéraux : Emmanuelle Berlier ; Jean Canarelli ; Candice Catillon ; Gilles Defrance ; Bruno Devie ; Henri-Pierre Doermann ; Éric Flatin ; Olivier Garnier ; Bruno Gauthier ; Caroline Gutsmuth ; Thomas Hottier ; Géraldine Jacob ; Laurent Kbaier ; Frédéric Lahiani ; Boris Loquet ; Frédérique de Monbrison ; Jovana Moularde ; Jean-Louis Pons ; Jean Michel Réal ; et Nicolas Roquigny.
« Le SDBIO se félicite de constater que ces élections ont été marquées par un net regain de mobilisation et de volonté d’engagement des biologistes libéraux adhérents du SDBIO. Avec un leitmotiv : la défense et le développement de la profession alors que celle-ci fait aujourd’hui face à des enjeux majeurs en matière de missions, de place dans le système de santé et de modèle économique. Le SDBIO est également heureux de constater la féminisation et le rajeunissement de ses élus. »
Pour le Syngev, le modèle des réseaux vétérinaires enfin reconnu
Alors que les adhérents du Syndicat des groupes d’exercice vétérinaire (Syngev, qui compte notamment Argos Vétérinaire, Anicura, IVC Evidensia, Mon Véto, Qovetia et VetPartners) ont fait l’objet de multiples attaques au cours des dernières années, le Conseil d’Etat a finalement reconnu le droit d’exercer au sein d’un réseau vétérinaire. Le Syngev salue cette décision qui vient clore une période d’incertitude sur l’avenir de la profession et ouvre la voie au développement pérenne des réseaux dans l’Hexagone.
Attendue de longue date, la décision rendue par le Conseil d’Etat à la suite des recours portés par plusieurs membres du Syngev constitue un tournant attendu pour les réseaux vétérinaires et leurs équipes. La plus haute juridiction administrative du pays dispose clairement que l’adhésion d’un établissement vétérinaire à un réseau ne porte nullement atteinte aux règles déontologiques de la profession, comme l’avait précédemment souligné la Commission européenne dans le cadre d’une lettre de mise en demeure de la France à l’été 2021.
Dans son arrêt, à la lueur du Code Rural, le Conseil d’Etat confirme la condition selon laquelle les vétérinaires en exercice doivent posséder plus de 50% des droits de vote. Par ailleurs, le Conseil d’Etat précise la notion d’actionnaire direct ou indirect, annulant ainsi l’interprétation de l’Ordre national des Vétérinaires. Les activités annexes sont par ailleurs jugées parfaitement compatibles avec l’actionnariat des cliniques vétérinaires.
L’arrêt du Conseil d’Etat clarifie également le cadre de la gouvernance des cliniques. Le Syngev regrette que les radiations des établissements visés par une procédure soient confirmées et fondées sur cet unique motif. Cela donne cependant l’opportunité à l’Ordre national des Vétérinaires ainsi qu’aux réseaux de cliniques vétérinaires de travailler conjointement sur l’élaboration de nouvelles règles définissant la gouvernance des sociétés vétérinaires appartenant à un groupe.
Désormais, le Syngev va pouvoir se consacrer pleinement à sa mission d’accompagner le développement de l’exercice vétérinaire en réseau. Aujourd’hui, 20 % des vétérinaires français ont fait ce choix, et le mouvement se poursuit. La profession se modernise et se rajeunit, et les nouveaux praticiens expriment des attentes nouvelles : accès à du matériel de pointe, formation tout au long de la vie, équilibre entre vie professionnelle et vie personnelle, flexibilité du temps de travail, collaboration avec leurs pairs… Pour répondre à ces nouveaux besoins, les cliniques doivent réaliser d’importants investissements dans la formation et le matériel médical, auxquels l’appui des réseaux contribue fortement.
Le développement des réseaux vétérinaires favorise l’accès à une médecine animale de pointe et de proximité et contribue à garantir la continuité des soins sur l’ensemble du territoire, notamment lors des gardes les soirs et les week-ends.
Le microbiote digestif influence la réponse immunitaire antitumorale après une allogreffe de cellules souches hématopoïétiques
L’allogreffe de cellules souches hématopoïétiques (CSH) est un des traitements curatifs des cancers hématologiques. Malgré son efficacité, la rechute de ces hémopathies malignes reste la première cause de décès dans les cinq ans qui suivent une allogreffe.
En 2017, l’étude ALLOZITHRO, promue par l’APHP, a mis en évidence une augmentation du risque de rechute des hémopathies malignes après une allogreffe de CSH chez des patients recevant de l’azithromycine, antibiotique de type macrolide.
Une équipe de recherche a alors étudié des échantillons de selles et de sang collectés prospectivement chez 55 patients afin d’étudier l’effet de cet antibiotique sur le microbiote digestif et donc possiblement sur la réponse immunitaire anti-tumorale.
Les échantillons de selles des patients ont été conservés grâce aux collections d’échantillons biologiques du Pr Jérôme Le Goff (service de Virologie, hôpital Saint-Louis, AP-HP) et à la collection nationale de ressources biologiques Cryostem, dédiées aux complications post-allogreffes. Leur étude a montré qu’il est possible de classer les populations bactériennes composant le microbiote digestif de ces patients allogreffés et recevant de l’azithromycine ou un placebo en quatre ensembles distincts, avec des compositions bactériennes spécifiques, appelés « entérotypes ». Ces entérotypes peuvent alors être associés soit à la rechute soit à la rémission complète un an après la greffe.
Il a été ensuite démontré qu’au sein de ces entérotypes, certaines espèces bactériennes étaient spécifiquement associées à une signature métabolique et immunitaire particulière. Ainsi, les patients de l’entérotype 2 étaient en rémission complète dans 95 % des cas, avec un effet protecteur d’un taxon de Bacteroides et de Prevotella. A l’inverse, la présence de Bacteroides affiliés à l’espèce fragilis (Bfra) était liée à un sur-risque de rechute. La présence de ces bactéries Bfra est non seulement associée à une signature métabolique et à des espèces virales spécifiques dans les selles, mais également à des métabolites bactériens et à un profil immunitaire spécifiques dans le sang. Ainsi, les patients porteurs de Bfra présentaient une proportion plus importante de lymphocytes T épuisés. Ces cellules immunitaires, initialement capables de reconnaître et détruire des cellules cancéreuses, expriment dans ce contexte des marqueurs particuliers (TIGIT, PD1 et TOX) qui réduisent leur capacité à développer une réponse antitumorale efficace après une allogreffe de CSH.
Ainsi, les communautés microbienne et virale du microbiote digestif peuvent être influencées par la prise d’un antibiotique comme l’azithromycine, ce qui peut impacter directement la capacité du système immunitaire à lutter efficacement contre des cellules cancéreuses. Ces données ouvrent la voie vers des thérapies visant à moduler la composition du microbiote digestif pour la prévention des rechutes après une allogreffe de cellules souches hématopoïétiques.
VALLET N et al., Cell Host & Microbe, online 17 July 2023
AFIB 2023 : Technologies et Agilité Biomédicales, le meilleur est Avenir
Le congrès des ingénieurs biomédicaux de l’AFIB se déroulera du 27 au 29 septembre 2023 à Bordeaux, capitale de la Nouvelle Aquitaine, deuxième ville de France pour ses monuments classés au Patrimoine mondial de l‘Unesco et région des vins de Bordeaux réputés comme les meilleurs au monde.
La thématique principale de ces journées sera « Technologies et Agilité biomédicale, le meilleur est Avenir ».
Cette cuvée s’annonce déjà comme prometteuse avec une ferme volonté d’explorer le biomédical au-delà des frontières traditionnelles et de mettre en avant le meilleur des technologies de santé.
Confronté à des contextes économique et géopolitique particulièrement évolutifs mais aussi à des problématiques environnementales prégnantes, l’ingénieur biomédical est contraint d’exploiter toujours davantage ses capacités d’adaptation, son « agilité ». Les challenges sont chaque année plus complexes à relever.
Le programme scientifique de ces journées AFIB s’articulera donc autour du décloisonnement et de cette nécessaire agilité.
Les technologies ne seront pas en reste puisque les ateliers dédiés aux notions fondamentales permettront à ceux qui le souhaitent de se plonger ou replonger dans les tonneaux du savoir.
Des retours d’expériences variés seront présentés dans des domaines très différents, qu’ils soient en métropole, dans les DOM TOM ou à l’étranger. Goûter à ces différents nectars, sans en abuser, permettra à chacun de s’évader à travers les différentes fragrances…
Vous pourrez également distinguer les différents arômes de la Master Class qui devrait se révéler très surprenante grâce à ses assemblages variés.
Enfin nous aborderons comment traiter le mildiou de notre activité, à savoir l’épuisement au travail, pour mieux nous armer en vous proposant des clés managériales dans les différentes situations rencontrées.
Nous aurons l’honneur et le plaisir de partager avec vous autant de moments d’échanges professionnels constructifs que d’instants conviviaux inoubliables.
Pierre LOPES (Président du Comité Scientifique) et Fabien MARIETTE (Président du Comité d’Organisation)
AFIB, Association Française des Ingénieurs Biomédicaux
MANIFESTATIONS
Retrouvez dans Spectra Diagnostic N°27 :
BOURSE & BIOTECHS
Pfizer renoue avec les grandes transactions en fusions & acquisitions
Mathieu DURAND, Arsia AMIR-ASLANI
BIOTECHNOLOGIES
• Quand le plan « Innovation Santé 2030 » manque de sauce coréenne
Arsia AMIR-ASLANI, Ruth SUISSA, Rouba CHOKOR, Philippe LE
• La bioproduction nécessite un nouveau tissu industriel compétitif
Jean-Luc LENORMAND, Arsia AMIR-ASLANI
• Les futures pertes de brevets à l’origine d’un mouvement de consolidation dans la pharma
Guillaume LEBEL, Arsia AMIR-ASLANI
HISTOIRE DES SCIENCES MÉDICALES
Laveran : premier prix Nobel français de médecine
Patrice BOUREE, Francine BISARO
CAS BIOCLINIQUES
Syndrome de démyélinisation osmotique : À propos d’un cas et revue de la littérature
Fatima KELI, Sanae JABAL, Mustapha DANDAN, Aissam EL MAATAOUI
CAS BIOCLINIQUES
Une nouvelle IST chez l’Homme : la primo-infection à CMV. A propos de deux observations chez le sujet immunocompétent
Vincent JEANTILS, Patrice BOUREE
Newsletter Spectra Diagnostic N°26
BIOLOGIE MOLECULAIRE
Diagnostic moléculaire rapide des maladies néonatales
DiaSorin propose dans sa gamme de biologie moléculaire, le LIAISON® MDX.
Cet appareil sample-to-answer permet la réalisation d’une PCR en temps réel à partir d’un échantillon primaire. Grâce à son étape de lyse thermique, l’échantillon est extrait directement dans la chambre réactionnelle où l’amplification est réalisée.
Pouvant traiter jusqu’à 8 échantillons en parallèle dans un délai de 60 minutes, cet instrument trouve sa place dans tous les laboratoires.
Sa cadence lui permet de gérer les demandes urgentes, son menu possède une sélection de tests dédiés au diagnostic des maladies néonatales :
• Simplexa™ HSV1 & 2 Direct : détection et différenciation des HSV 1 & 2 dans les échantillons de LCR et les frottis de lésions cutanées/cutanéomuqueuses
• Simplexa™ VZV Direct : détection de l’ADN du virus varicelle zona dans les échantillons de LCR
• Simplexa™ VZV Swab Direct : détection de l’ADN du virus varicelle zona dans les échantillons de lésions cutanées/cutanéomuqueuses
• Simplexa™ Congenital CMV Direct : détection précoce de cette infection à partir des échantillons de salive et d’urine des nouveau-nés de moins de 21 jours.
• Simplexa™ GBS Direct : détection des streptocoques du groupe B à partir d’un enrichissement en bouillon de Lim.
BIOLOGIE MOLECULAIRE
Complexe Mycobacterium tuberculosis (cMTB) et mutations de résistance
A l’échelle mondiale, près de 10 millions de personnes souffrent de tuberculose (TB) chaque année.
En 2018, l’OMS a estimé qu’il y avait 484 000 nouveaux cas de résistance à la rifampicine (RR-TB), 78 % étant des cas de tuberculose multirésistante (MDR-TB). Parallèlement, 800 000 patients sont estimés sensibles à la rifampicine et résistants à l’isoniazide (Hr-TB).
BD contribue aux progrès du dépistage de la tuberculose multirésistante avec le kit BD MAX™ MDR-TB, une solution moléculaire intégrée et automatisée permettant de traiter 24 échantillons par série en moins de 4 heures. Cette solution de diagnostic permet la détection des espèces du complexe Mycobacterium tuberculosis (cMTB) et des mutations associées à la résistance à la rifampicine (RIF) et à l’isoniazide (INH).
Le kit BD MAX™ MDR-TB est soutenu par l’OMS : « Une étude multicentrique a révélé que le test BD MAX™ MDR-TB avait une sensibilité et une spécificité élevées pour la détection de Mycobacterium tuberculosis et des gènes des résistances à la RIF et à la INH, constituant un outil performant dans le dépistage rapide de la tuberculose et de ses résistances. »
BD, Becton Dickinson and Company
BIOLOGIE MOLECULAIRE
Logiciel d’analyse de données de pointe
bioMérieux lance Biofire® Fireworks™, un logiciel intégré innovant destiné aux systèmes Biofire® et conçu pour optimiser les services de laboratoires et faciliter la prise de décision à partir de données. Ce logiciel constitue le dernier ajout à BioMérieux Vision Suite, l’offre de solutions informatiques et d’analyse de données de bioMérieux pour améliorer l’efficacité et la productivité des laboratoires du monde entier.
Une gestion solide et centralisée des données est la clé pour exploiter pleinement les capacités des laboratoires modernes. En centralisant en un seul endroit tous les systèmes Biofire® Filmarray® utilisés par les laboratoires, Biofire® Fireworks™ permet une connectivité en temps réel non seulement des laboratoires centraux mais aussi des laboratoires hors site. En offrant un contrôle complet des performances des systèmes Biofire® et en permettant l’accès aux données de n’importe où et à n’importe quel moment, les laboratoires peuvent optimiser leurs flux de travail et gagner en autonomie tout en maîtrisant leurs opérations.
Biofire® Fireworks™, avec son interface conviviale, ses filtres personnalisables, et son intégration optimale, peut être l’outil de gestion centralisée des données que les laboratoires attendent.
Mark Miller, Directeur Exécutif, Affaires Médicales, explique : « Avec 70 % des décisions médicales reposant sur des résultats de tests de laboratoire, les données sont l’élément vital de la prise en charge. Désormais, Biofire® Fireworks™ permet aux laboratoires d’exploiter la puissance des données, dévoilant des informations qui étaient auparavant cachées. Chaque échantillon analysé, chaque résultat fourni permet aux laboratoires, grâce à bioMérieux, de sauver des vies et d’améliorer la santé des patients. »
Biofire® Fireworks™ a été conçu, développé et déployé pour assurer la sécurité des données des patients et des clients, dans le respect des normes et réglementations du secteur. Les clients ont un contrôle total sur leurs données, ce qui leur permet de gérer leurs informations comme ils l’entendent.
Biofire® Fireworks™ est déjà utilisé dans plusieurs sites pilotes à travers le monde. Une prochaine étape dans le développement de Biofire® Fireworks™ sera l’intégration complète de Biofire® Syndromic Trends – un réseau mondial de surveillance des maladies créé par bioMérieux pour les utilisateurs des panels Biofire®.
BioMérieux Vision Suite transforme les données des laboratoires et des hôpitaux en informations utiles et exploitables afin de faciliter la prise de décision diagnostique et clinique à tous les stades, de la prise en charge individuelle des patients à la surveillance de la santé publique, pour mieux soutenir la bonne gestion des antibiotiques.
IMMUNOANALYSE
Prise en charge des traumatismes crâniens légers
Les traumatismes crâniens légers (TCL) sont un problème de santé publique. Ils constituent la majorité des cas de traumatismes crâniens (environ 80 %) et présentent un risque faible mais réel de complications graves.
La prise en charge des patients victimes de TCL (Score de Glasgow supérieur ou égal à 13) repose sur des règles anamnestiques et cliniques permettant d’établir au mieux le risque de lésions intracrâniennes (LIC). Le scanner cérébral (tomodensitométrie cérébrale) reste l’examen de référence. Cette pratique, d’une excellente sensibilité en matière de détection de LIC, révèle dans la majorité des cas des images normales. Son utilisation a cependant des conséquences pour le patient en termes de rayonnement et un impact pour le service des urgences au niveau des coûts et de l’engorgement potentiellement important.
Ainsi, tout l’enjeu de la prise en charge initiale de ces TCL est d’identifier les patients qui sont à risque de LIC et de poser l’indication du scanner cérébral.
La Société Française de Médecine d’Urgence (SFMU) et la Société Française d’Anesthésie et Réanimation (SFAR) ont publié en septembre 2022 des Recommandations de Pratiques Professionnelles (RPP) sur la prise en charge des patients adultes présentant un traumatisme crânien léger.
Dans ces RPP, les experts proposent de réaliser un dosage sanguin de la protéine S100b, lorsque celui-ci est disponible, dans les 3 heures suivant le traumatisme crânien léger, chez les patients adultes à risque intermédiaire pour limiter le nombre de scanners cérébraux.
Une étude multicentrique a permis d’obtenir sur le kit DiaSorin Liaison® S 100 une sensibilité de 96,3 % et une valeur prédictive négative de 99,6 % à un seuil de 0,15 µg/L, seuil physiologique au-delà duquel la valeur obtenue peut révéler des LIC.
Ainsi, le dosage Liaison® S 100 disponible sur les analyseurs Liaison® XL répond à de nombreux critères indispensables à son utilisation en pratique clinique : très bonnes sensibilité et valeur prédictive négative, temps d’analyse et automatisation du dosage adaptés à l’urgence (34 min).
EQUIPEMENT DE LABORATOIRE
Osmomètre automatisé multi échantillons
Depuis de nombreuses années, afin de compléter sa gamme de biologie d’urgence, Radiometer France distribue de manière exclusive la gamme Advanced Instruments dans le domaine du diagnostic in vitro. Elle complète aujourd’hui cette offre avec l’OsmoPRO MAX, premier osmomètre à échantillons multiples travaillant sur tubes primaires.
L’échantillonnage automatique sur 200 µL de sérum ou d’urine permet de s’affranchir de l’étape de pipetage manuel tout en minimisant les biais opérateurs au sein des plateaux techniques.
Il est possible de programmer le dispositif pour traiter les échantillons en double, en triple ou selon tout protocole d’échantillonnage requis par le laboratoire.
Ce nouvel osmomètre convient parfaitement aux laboratoires à qui il est demandé de rendre des résultats plus rapidement tout en disposant de moins de ressources. Un carrousel permettant le chargement de 20 échantillons s’adapte aux différentes tailles et formes de tubes des laboratoires les plus courants. Des micro-tubes et des adaptateurs peuvent également être utilisés.
Son système de gestion des fluides en boucle fermée nettoie après chaque échantillon pour éliminer le transfert et la contamination croisée des échantillons. Ces fonctions permettent un traitement flexible des échantillons tout en minimisant le report des échantillons et la contamination croisée.
Il est fourni avec la liste complète des fonctions de contrôle qualité, notamment : un mode superviseur avec protection par mot de passe, possibilité de définir des limites de portée pour les solutions de contrôle, surveillance statistique du contrôle qualité quotidien et journal des événements du système à des fins de diagnostic.
Enfin, le système propose des communications de données bidirectionnelles ainsi qu’une base de données de résultats intégrée avec fonction de recherche, facilité par la présence d’un port Ethernet et de plusieurs ports USB.
bioMérieux et JMI Labs s’associent dans la lutte contre l’antibiorésistance
En avril, Biomérieux a tout d’abord signé un partenariat stratégique avec Oxford Nanopore Technologies plc, qui propose une technologie de détection moléculaire nouvelle génération utilisant des nanopores. Les deux sociétés comptent explorer les possibilités de déploiement du séquençage par nanopore pour la recherche clinique et le marché des solutions de diagnostic in vitro (DIV).
Vers le séquençage par nanopore
Cette technologie innovante analyse de longs fragments d’ADN ou d’ARN, en mesurant les variations d’un courant électrique générées lorsque les acides nucléiques passent à travers un nanopore protéique. Le signal résultant est décodé pour fournir la séquence spécifique d’ADN ou d’ARN. Parce qu’elle est évolutive et donne des résultats en temps réel, cette technologie unique est idéale pour la caractérisation rapide, et à coût raisonné, d’agents pathogènes dans des échantillons cliniques.
La société Oxford Nanopore offre une identification rapide et précise des pathogènes microbiens et de leur résistance aux antibiotiques. Elle bénéficie ainsi d’un positionnement unique pour fournir des solutions de séquençage par nanopore délivrant des résultats complets et en temps réel.
Les domaines initiaux de collaboration comprennent : un test pour déterminer la résistance aux antibiotiques en cas de tuberculose ; un test pour identifier des pathogènes dans des échantillons cliniques en principe stériles ; et la validation de la plateforme de séquençage d’Oxford Nanopore avec l’application BioMérieux Episeq® CS pour le suivi rapide des foyers d’infection dans les établissements de santé.
JMI et le programme SENTRY
Le lyonnais a ensuite conclu un partenariat de 6 ans avec JMI Laboratories pour mener des projets collaboratifs d’évaluation des performances et du potentiel de diagnostics microbiologiques rapides et innovants, des outils importants dans la lutte contre l’antibiorésistance. JMI a été acquis en novembre 2021 par le groupe Element, un leader mondial dans le domaine des tests, de l’inspection et de la certification (TIC).
JMI est réputé pour ses travaux dans les domaines des thérapies antimicrobiennes, de la surveillance de pointe, de la pharmacovigilance et des antibiogrammes. JMI a en particulier mis en place le programme Sentry en 1997 pour surveiller les agents pathogènes dans le monde entier et suivre l’évolution des profils de résistance au fil du temps. Il est actuellement un des plus anciens programmes de surveillance des antibiotiques au monde.
Si les programmes de bon usage des antibiotiques dépendent essentiellement de tests rapides et fiables, il est essentiel que les résultats des antibiogrammes soient continuellement évalués par rapport à des souches nouvelles d’agents pathogènes du monde entier qui peuvent avoir développé de nouveaux mécanismes de résistance ou des niveaux supplémentaires de résistance aux traitements actuels. Grâce à ce partenariat avec JMI, bioMérieux sera en mesure d’évaluer constamment les résultats des antibiogrammes/AES et de les valider en fonction de l’évolution des données mondiales sur la sensibilité aux antibiotiques recueillies dans le cadre du programme Sentry.
Le programme Sentry recueille chaque année environ 40 000 isolats cliniques de flore bactérienne et fongique par le biais d’un réseau de plus de 150 centres médicaux de plus de 35 pays, afin de surveiller la prévalence de l’antibiorésistance.
« Grâce à nos efforts combinés, nous pouvons alerter très tôt la communauté scientifique sur les menaces potentielles croissantes et orienter efficacement la recherche et le développement sur les antibiotiques » explique François Lacoste, Directeur Exécutif, R&D, bioMérieux.
SYNLAB teste le transport d’échantillons par drone
A la recherche de solutions innovantes améliorant la rapidité des services diagnostics des laboratoires, tout en réduisant les émissions de CO2 et la consommation d’énergie, SYNLAB France a procédé à son premier test de transport d’échantillons biologiques par drone, le 10 mai à l’aéroport du Havre.
Le transport en drone était préprogrammé et supervisé à distance par des pilotes professionnels de la start-up normande Delivrone, partenaire de SYNLAB pour cette expérimentation. Spécialement conçu pour ce type de transport, le drone permet aux laboratoires d’acheminer au choix 150 prélèvements, 3 poches de sang, 350 vaccins ou encore 28 prélèvements urinaires entre le lieu de prélèvement et le plateau technique d’analyses.
Le drone, sélectionné par SYNLAB France, respecte les conditions pré-analytiques et préserve l’intégrité des échantillons en garantissant une température constante, de – 20°C jusqu’à + 25°C, ainsi que la traçabilité de la température des prélèvements, tout au long de leur transport.
Le recours au drone permettrait de réduire considérablement l’empreinte carbone de la logistique médicale en réduisant de 90 % les émissions de CO2. Avec une vitesse de 150 Km/h, une portée de 100 Km et une altitude de vol maximale de 120 mètres permettant de s’adapter au relief, le transport par drone s’avère être cinq fois plus rapide que le transport médical routier habituel.
Pour autant, ce type de vol reste à un stade expérimental car de nombreuses conditions sont encore à réunir pour s’assurer de la faisabilité et de la rentabilité de ce type de transport « en mode routine » : autorisation de vol au-dessus d’agglomérations, pilotes professionnels, sécurité en cas de chute…
Delivrone est une start-up française basée à Rouen et fondée en 2021 par deux multi-entrepreneurs, Pierre Lebel et Gautier Dhaussy. La société ambitionne d’améliorer la santé du plus grand nombre et de révolutionner la logistique médicale en la rendant plus rapide et plus écologique.
Diagast investit dans la sécurité et la souveraineté sanitaire
Diagast, société française pionnière de l’Immuno-Hématologie, lance un plan d’investissement pour renforcer la sécurité des transfusions sanguines et garantir la souveraineté sanitaire par la production de clones.
Ce plan doté d’une enveloppe de 26,5 millions d’euros comprend l’allocation de 6,5 millions d’euros obtenue par la société dans le cadre du Plan France 2030.
Ce plan a pour vocation de permettre à la société d’atteindre ses objectifs en termes de sécurité transfusionnelle et de souveraineté sanitaire, notamment par l’augmentation du nombre de clones et la multiplication par 4 de la capacité de production sur le site historique de Loos, dans le Nord de la France.
2e producteur mondial d’anticorps monoclonaux en Immuno-Hématologie avec une couverture de 70 % de production des exigences nécessaires pour garantir une autonomie totale et une sécurité complète lors des transfusions sanguines, l’ambition de Diagast est d’atteindre les 100 % avec ce plan d’investissement et de garantir la souveraineté sanitaire française et mondiale.
Ce plan permettra également de :
• enrichir et compléter la gamme d’anticorps monoclonaux,
• moderniser et développer les outils de bioproduction de la société,
• contribuer au renforcement des capacités nationales
• partager le savoir-faire de l’entreprise en termes de bioproduction en mettant son expertise et ses outils à disposition de ses partenaires.
Cette démarche marque une nouvelle étape dans le projet de Diagast de maintenir les normes les plus élevées en matière de sécurité transfusionnelle.
Launch va distribuer la gamme Liofilchem
LAUNCH Diagnostics France SAS distribue désormais les produits de la gamme Liofilchem sur le territoire français. La gamme Liofilchem représente une solution complète de microbiologie :
• Antibiorésistance : des bandelettes de test CMI, des tests de synergie antimicrobien, des disques antibiotiques, des kits de microdilution en bouillon, des kits de dilution en gélose ;
• Identification microbienne : des milieux chromogènes, des galeries, des tests colorimétriques ;
• Milieux de culture : des milieux prêts à l’emploi en boîte de Pétri, tubes, flacons et lames, des milieux de culture déshydratés, des suppléments sélectifs.
Depuis 1983, Liofilchem est basée à Roseto degli Abruzzi, en Italie, où l’ensemble des processus de R&D, de production et de contrôle qualité sont effectués. Liofilchem est certifiée ISO 9001, ISO13485 et développe des produits répondant aux normes internationales et aux demandes spécifiques des clients.
Les produits Liofilchem sont utilisés dans plus de 130 pays dans le monde.
Lionel Collet est nommé président de la Haute Autorité de santé
Le Président de la République a nommé le Pr Lionel Collet président de la Haute Autorité de santé à compter du 19 avril 2023. Il succède au Pr Dominique Le Guludec, dont le mandat avait débuté en décembre 2017.
Docteur en médecine et en biologie humaine, Lionel Collet est nommé en 1984 médecin hospitalo-universitaire à l’université Claude Bernard Lyon et aux hospices civils de Lyon, puis, en 1992, professeur des universités-praticien hospitalier. Il occupe le poste de chef du service d’audiologie et explorations orofaciales aux hospices civils de Lyon de 1999 à 2012. Il dirige le laboratoire Neurosciences et systèmes sensoriels du CNRS de 1991 à 2006, puis préside l’université Claude-Bernard Lyon-I entre 2006 et 2011, ainsi que la conférence des présidents d’universités de 2008 à 2010.
De 2012 à 2013, il est le directeur de cabinet de la ministre de l’Enseignement supérieur et de la Recherche, Geneviève Fioraso. En octobre 2013, il est nommé conseiller d’État. Il copilote avec Anne-Marie Brocas la « Grande conférence de santé » en 2016 et coordonne le Conseil stratégique des industries de santé de 2015 à 2017. Il préside les conseils d’administration de l’Institut de veille sanitaire (InVS) et de l’Établissement de préparation et de réponse aux urgences sanitaires (EPRUS, 2015-2016), avant de devenir en juillet 2016 président du conseil d’administration de la nouvelle agence nationale de santé publique, Santé Publique France, fonction qu’il occupe jusque fin 2017. De mai 2017 à mars 2018, il est conseiller spécial auprès d’Agnès Buzyn, alors ministre des Solidarités et de la Santé.
Président du collège de déontologie de l’AP-HP entre 2019 et 2021, le Pr Lionel Collet est nommé à la présidence du Conseil national de la certification périodique en décembre 2021. Depuis janvier 2023, il était également membre du Conseil national du sida et des hépatites virales (CNS). Le Pr Lionel Collet est par ailleurs membre correspondant de l’Académie nationale de médecine depuis 2019.
UniHA nomme 4 nouveaux coordonnateurs de filières d’achat
UniHA, premier réseau coopératif d’achats groupés des établissements hospitaliers publics français, vient de nommer les nouveaux coordonnateurs de quatre de ses filières d’achat :
• Raphaël Yven, secrétaire général du CHU de Bordeaux, coordonnateur filière Énergie UniHA
• Valérie Mermet, Pharmacien Praticien hospitalier, responsable du Département Achats Biomédicaux HCL, coordonnatrice filière Consommables & Équipements des Unités de Soins UniHA
• Marie Le Mée, Directrice adjointe à la DALISE au CHU de Saint-Etienne, coordonnatrice filière Blanchisserie UniHA
• Thibaud Arnauld des Lions, Directeur adjoint CHU d’Angers, coordonnateur filière Restauration UniHA
Ces nominations renforcent l’engagement d’UniHA en faveur du développement durable, qui est au cœur des orientations fixées par la nouvelle gouvernance, l’ambition du groupement étant de devenir le partenaire incontournable des hôpitaux publics dans leurs actions de décarbonation.
Tel est tout particulièrement le cas de la filière Énergie, l’une des plus importantes filières d’UniHA en termes de périmètre (plus de 440 millions d’euros en 2022, ce qui fait d’UniHA le premier opérateur d’achat d’énergie pour les établissements de santé, réunissant de très nombreux CHU, dont l’AP-HP).
La stratégie « sobriété et décarbonation », portée par UniHA en termes d’achat d’énergie, a pour objectif de fortement développer et renforcer l’offre de prestations et les accompagnements au service de la transition énergétique des établissements de santé, les protéger des évolutions mondiales sur le marché de l’énergie, limiter leur empreinte environnementale et adapter leur fonctionnement aux conséquences des crises écologiques. Cela passera par le déploiement d’outils et de services pour amener les établissements à diminuer leurs consommations d’énergie mais aussi à acheter et produire des énergies décarbonées.
Un diagnostic précoce de maladies graves par biomarqueurs peptidiques
Les peptides sont des biomarqueurs de choix pour le diagnostic de maladies graves à partir de biofluides, mais les techniques actuelles pour doser ces biomarqueurs sont longues, coûteuses et pas assez sensibles. Dans une étude parue dans ACS Central Science, des scientifiques démontrent la possibilité d’identifier de manière unique les biomarqueurs peptidiques de la coagulation grâce à leur signature électrique à travers un nanopore.
La détection précoce de maladies graves à des fins de prévention est, avec la gestion personnalisée des traitements, un des défis majeurs en matière de santé. Le développement de nouveaux tests analytiques très sensibles est nécessaire pour la détection directe de biomarqueurs à partir de biofluides. Par exemple, les troubles de la coagulation associés à un accident vasculaire cérébral, une crise cardiaque ou un cancer peuvent être reliés à l’évolution de biomarqueurs, en particulier, au biomarqueur fibrinopeptide A (FPA). Ce biomarqueur est une protéine qui existe sous plusieurs formes appelées variants. Les dosages actuels ne parviennent pas à discriminer entre ces variants et le FPA est donc sous-exploité comme biomarqueur pour la pratique clinique de routine.
Dans ce contexte, des scientifiques du Laboratoire analyse, modélisation et matériaux pour la biologie, et l’environnement (LAMBE, CNRS/Université Paris-Saclay-Evry/CYU Cergy) et du Centre de ressources biologiques Lariboisière (CRB/Hôpital Lariboisière), en collaboration avec la start-up Dreampore, ont utilisé la détection électrique à travers un nanopore (10-9 m) pour identifier le FPA et ses variants, le FPA phosphorylé et deux autres dérivés. Cette technique d’analyse permet de détecter et d’identifier une seule espèce dans le nanopore à l’aide d’une mesure électrique. Par application d’une différence de potentiel entre deux compartiments remplis d’une solution ionique et séparés par une membrane percée d’un nanotrou, on peut mesurer un courant ionique. Quand une espèce entre dans le nanopore, elle bloque partiellement les ions et entraîne une chute de courant en fonction de sa nature chimique, de sa conformation et de sa taille.
L’étude parue dans ACS Central Science montre que cette technique permet de caractériser chaque variant du peptide FPA par un signal électrique unique. Les scientifiques ont également montré que la forme phosphorylée de FPA, un de ces variants, pouvait adopter deux conformations différentes, chacune ayant des réponses électriques différentes. Cette technique permet donc de discriminer simplement entre chaque variant dans un mélange, ouvrant la voie au développement de nouveaux tests de diagnostiques portables sensibles.
STIERLEN A et al., Nanopore Discrimination of Coagulation Biomarker Derivatives and Characterization of a Post-Translational Modification, ACS Cent Sci, 2023; 9(2):228-238
Une souche de Shigella sonnei hautement résistante aux antibiotiques en France
La shigellose est une maladie diarrhéique très contagieuse, de transmission oro-fécale. Parmi ses différents types, Shigella sonnei est le type majoritaire qui circule dans les pays industrialisés ou en cours d’industrialisation. Les infections à S. sonnei peuvent entrainer une diarrhée de courte durée (3-4 j) cédant spontanément. Un traitement antibiotique devient cependant nécessaire pour les cas modérés à sévères (diarrhée sanglante, risque de complications) ou pour stopper la transmission entre les personnes dans des contextes épidémiques. L’acquisition par la bactérie de mécanismes de résistance aux antibiotiques limite alors les options thérapeutiques.
Or, les scientifiques du CNR des Escherichia coli, Shigella et Salmonella (CNR-ESS) à l’Institut Pasteur, ont montré une augmentation de la résistance aux antibiotiques chez les souches de S. sonnei isolées en France depuis 17 ans. L’étude se base sur l’analyse de plus de 7 000 souches de S. sonnei et d’informations épidémiologiques recueillies dans le cadre de la surveillance nationale des shigelloses par le CNR-ESS entre 2005 et 2021. Au cours de cette période, des souches dites hautement résistantes aux antibiotiques (ou XDR pour extensively drug-resistant) ont été identifiées pour la première fois en 2015. Puis, la proportion de ces souches résistantes à quasiment tous les antibiotiques recommandés pour le traitement de la shigellose, a augmenté de façon importante jusqu’au pic de 2021 : 22,3 % de toutes les souches de S. sonnei étaient hautement résistantes cette année-là (soit 99 cas).
D’après le séquençage génomique, toutes ces souches XDR françaises appartenaient à une même lignée évolutive devenue résistante à un antibiotique clé, la ciprofloxacine, vers 2007 en Asie du Sud. Puis, ces souches ont acquis dans plusieurs régions du monde, dont la France, différents plasmides codant pour la résistance à d’autres antibiotiques de première ligne (azithromycine et céphalosporines de 3e génération notamment). Pour les cas sévères, les seuls antibiotiques restant efficaces sont les carbapénèmes ou la colistine, en IV, soit un traitement plus agressif avec un suivi plus complexe à l’hôpital.
LEFEVRE S et al., Rapid emergence of extensively drug-resistant Shigella sonnei in France, Nature Communications, 2023; 14:462, doi:10.1038/s41467-023-36222-8
MANIFESTATIONS
Retrouvez dans Spectra Diagnostic N°26 :
BOURSE & BIOTECHS
La bourse ne réagit plus aux annonces de GENFIT
Arsia AMIR-ASLANI, Philippe LE
CAS BIOCLINIQUES
Atteinte neurologique chez un sujet jeune : un cas typique d’intoxication au gaz hilarant
Laura PLASSE, Marie GIROT, Quentin VANNOD, Marjorie MATEOS,
Romane LOLLIOT, Émeline GERNEZ, Vincent MASSO, Guillaume GRZYCH
BIOACTEUR
Jean-Alfred Fournier : un pionnier dans la lutte contre la syphilis
Patrice BOUREE, Jean-Marc BOHBOT
HISTOIRE DES SCIENCES MÉDICALES
Des locaux hospitaliers encore imprégnés par le mercure et l’arsenic utilisés contre la syphilis
E. BRANTHOMME, P. BOUREE
CAS BIOCLINIQUES
L’infection ostéo-articulaire de l’épaule à Coxiella burnetii : à propos d’une forme rare d’ostéolyse
Patrice BOUREE, Raphael USUBILLAGA, Etienne CANOUI, Maya Enser,
Wiem BOUCHNEB, Philippe ANRACT, Dominique SALMON
Newsletter Spectra Diagnostic N°25
EQUIPEMENT DE LABORATOIRE
Spectromètre polyvalent de nouvelle génération
Avantes, un fabricant innovant de solutions de spectroscopie des Pays-Bas, ambitionne de révolutionner ce domaine avec la sortie du spectromètre Pacto. De l’analyse du sang dans le domaine médical au contrôle de qualité en ligne dans le tri des fruits, cet appareil polyvalent et puissant assure une large utilisation dans diverses applications et industries.
Disponible en plusieurs configurations selon les applications et les exigences spécifiques des utilisateurs, il offre d’excellentes caractéristiques optiques, un rapport signal/bruit élevé et une performance globale haut de gamme à une vitesse rapide. Il est également compatible avec les sources lumineuses, les accessoires et le logiciel AvaSoft d’Avantes, ce qui permet une intégration facile avec d’autres produits ou systèmes.
L’une des principales caractéristiques qui distingue le Pacto des autres spectromètres est sa capacité de personnalisation pour répondre à des besoins spécifiques. En utilisant différentes grilles et fentes, ses performances peuvent être adaptées à l’application. De plus, il permet de choisir parmi différents protocoles de communication, ce qui augmente encore sa polyvalence.
Le Pacto est produit avec AvaMation, un processus de fabrication semi-automatisé qui assure une reproductibilité supérieure entre les instruments, garantissant la précision et la cohérence des mesures.
ANALYSES
Différencier avec précision les infections : bactériennes ou virales ?
Grâce au partenariat entre les sociétés MeMed et DiaSorin, le test LIAISON® MeMed BV™ est disponible sur les analyseurs LIAISON® XL et LIAISON® XS.
Issue du savoir-faire de chacune des sociétés, ce test est la première solution entièrement automatisée basée sur la réponse immunitaire de l’hôte pour permettre aux cliniciens de différencier avec précision les infections bactériennes des infections virales. Cette solution innovante combine le dosage de 3 protéines de la réponse immunitaire de l’hôte (TRAIL, IP-10 et CRP) à partir d’un échantillon sérique.
Les résultats sont combinés pour fournir un score, une signature protéique, permettant de discriminer de façon extrêmement fiable, par rapport aux biomarqueurs actuels, les infections (et co-infections) bactériennes des infections virales, chez les adultes et les enfants suspects d’infection aiguë.
La disponibilité de ce test sur les analyseurs DiaSorin LIAISON® XL & LIAISON® XS fournit un outil précieux face à la menace mondiale croissante posée par la résistance aux antibiotiques. Selon l’OMS, la résistance aux antimicrobiens est l’une des 10 principales menaces mondiales pour la santé publique de
l’humanité et on estime qu’elle tue 700 000 personnes par an dans le monde dont 33 000 en Europe. La distinction entre les étiologies bactériennes et virales dans les infections aiguës est un défi universel pour les prestataires de soins de santé.
Les pratiques actuelles telles que les antécédents médicaux et d’autres tests médicaux fournissent des réponses incomplètes, en particulier lorsque le site de l’infection est inaccessible. En s’appuyant sur la réponse immunitaire de l’hôte, plutôt que sur la détection directe d’agents pathogènes, ce nouveau test complète les technologies conventionnelles pour une décision précoce de traitement antibiotique mieux éclairée.
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Un nouveau middleware de microbiologie
Lancé par BioMérieux, Maestria™ est un middleware de nouvelle génération, destiné aux laboratoires de microbiologie. Il vise à fournir un outil pour centraliser la gestion du flux de travail de toutes les activités de routine et donner de la valeur aux données de microbiologie.
Cette solution intégrée permet de répondre aux défis croissants du laboratoire : charges de travail plus élevées, accréditations plus strictes, besoin d’indicateurs de qualité et de performances, nécessité d’obtenir des résultats plus rapides tout en réduisant les coûts.
Maestria™ propose :
• un tableau de bord de pilotage de l’activité microbiologique du laboratoire entièrement configurable et paramétrable. Maestria™ centralise les interfaces des différents instruments du laboratoire (hémoculture, spectromètre de masse, antibiogramme, CMI rapide…) ainsi que les résultats issus de techniques manuelles (GRAM, antibiogramme en diffusion, CMI…),
• une gestion des indicateurs de performance liés au temps et à la qualité en hémoculture dans un contexte de future labélisation des établissements de santé,
• un accompagnement du laboratoire de microbiologie dans la mise en place d’un programme de Bon Usages des Antimicrobiens : détection des BMR (Bactéries Multi-Résistantes) et des contaminants d’hémoculture, expertise antibiogramme, module d’antibiogrammes ciblés, module d’antibiogrammes cumulatifs.
Le système permet également de transformer les statistiques par requêtes en tableaux de bord dynamiques, interactifs et en temps réel grâce à son nouveau module complémentaire Clarion™ Lab Analytics.
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Secrétariat augmenté : une saisie automatisée pour l’accueil patient optimisé
La société Odroa a annoncé l’arrivée de HEELON Ordo, un robot intégrateur d’ordonnances utilisant l’Intelligence Artificielle auto-apprenante HEELON.IA. Présenté en avant-première aux derniers BioMed-J, il permet instantanément la lecture, la traduction et l’intégration des informations des ordonnances de biologie médicale dans le SIL, quelle que soit l’origine de l’ordonnance (médecin généraliste et spécialiste, hôpitaux, clinique, EHPAD, laboratoires périphériques) et quel que soit le SIL.
Ce robot intégrateur gère d’ores et déjà toutes les ordonnances créées informatiquement, via un LAP (Logiciel d’Aide à la Prescription) ou un simple traitement de texte, vous permettant ainsi de fluidifier et de fiabiliser l’enregistrement à l’accueil du laboratoire comme au centre de tri du plateau technique.
Son utilisation permet de gagner du temps et améliore également la sécurisation du processus d’enregistrement.
En effet, le robot va :
• reconnaître les mots,
• les associer à chaque mention nécessaire à la validité d’une ordonnance,
• confronter les éléments de la partie administrative de l’ordonnance aux annuaires RPPS, FINESS et AMELI,
• confronter les éléments de la partie technique de l’ordonnance aux annuaires NABM, LOINC et BIOLOINC, ainsi qu’aux tables du laboratoires, souvent spécifiques au mode de traitement des analyses d’un établissement ou d’un service clinique particulier.
L’ordonnance numérique se déploie progressivement depuis 2022 et est appelée à être généralisée au plus tard le 31 décembre 2024, dans un premier temps avec un QR code et imprimée sur papier, dans l’attente de la publication des textes permettant le déploiement d’un dispositif tout numérique.
INFORMATIQUE DE LABORATOIRE
Optimisation du suivi des échantillons inter-sites
La gestion et le suivi de l’acheminement des échantillons est un enjeu important pour les laboratoires de biologie qui doivent garantir les délais analytiques et la qualité des analyses à leurs patientèles. Entre le site de prélèvement et le laboratoire exécutant, les intervenants sont nombreux et accéder au statut des échantillons n’est pas toujours simple.
Rarement agnostiques et universelles, les applications assurant ce suivi sont souvent, soit associées au Système de gestion du laboratoire, soit associées au logisticien, voire au Middleware.
Ce n’est pas la stratégie de la société Softway Medical Biologie. Son nouveau module de suivi d’acheminement d’échantillons, Colisya est indépendant du système d’information du laboratoire, il s’interface avec un ou plusieurs SIL, quel qu’en soit l’éditeur, et s’adapte aux spécificités d’exercice d’une ou plusieurs SELAS.
Utilisable en mobilité et sur tout support (fixe, smartphone, tablette), Colisya est accessible à tous les intervenants de la chaîne d’acheminement habilités (coursiers, techniciens, administrateur). Au travers d’une interface intuitive totalement paramétrable, il assure le suivi et la traçabilité en temps réel de toutes les étapes de l’acheminement.
Colisya, s’adapte à tous les usages en matière de mise en colis et de réception (par tube, par sachet, par colis) et permet de visualiser facilement le synoptique des tournées (départ, étapes intermédiaires, arrivée) en respectant leurs particularités (fréquence, étapes, identification par code barre).
Avec Colisya, le laboratoire de biologie médicale devient plus agile pour monitorer une logistique des échantillons adaptée à ses propres contraintes, au bénéfice de la patientèle.
MATERIEL DE LABORATOIRE
Système clos de recueil des urines sans aiguille
Sarstedt veut ré-inventer le prélèvement des échantillons d’urine. La gamme NFT* de Sarstedt pose de nouveaux jalons pour le préanalytique de l’urine : disponible en pot de 100 mL et en flacon de 3 L, cette nouvelle génération de dispositif de prélèvement, associée aux tubes urine de la société (version neutre ou avec stabilisateur) supprime l’utilisation d’une aiguille lors des recueils urinaires sur miction et sur urines de 24 h tout en conservant le bénéfice hygiénique du système clos.
La suppression pure et simple des risques de blessures et la sécurité d’utilisation accrue, du fait de l’absence d’aiguille, sont des avantages indéniables pour le personnel et les patients et s’inscrivent dans le cadre de la directive Européenne sur la sécurité.
D’autre part, sans aiguille, l’élimination des pots se fait à moindre coût puisque les récipients à aiguilles (DASRI OPCT) ne sont plus nécessaires pour les éliminer.
La gamme NFT permet donc un recueil hygiénique, sécurisé et pratique des échantillons urinaires.
* Needle Free Transfert
Biosapientia, nouvel acteur de la biologie moléculaire en France
Créée en 2020, Biosapientia est une société française de distribution de solutions de diagnostic in vitro pour les laboratoires de biologie médicale. Spécialisée dans la fourniture d’équipements automatisés et de réactifs de biologie moléculaire, Biosapientia propose une gamme étendue de tests RT-PCR simplex et multiplex pour le dépistage et le suivi d’un large éventail d’agents infectieux pathogènes et la détection de mutations génétiques d’intérêt dans les domaines d’application suivants :
• Infections sexuellement transmissibles
• Quantification de la charge virale
• Infections respiratoires
• Infections gastro-intestinales
• Transplantation / Immunodéprimés
• Méningites / Infections du système nerveux
• Mutations thrombophiliques
• Oncohématologie
• Pharmacogénétique
• Génétique Humaine
• Microbiologie.
Pour la réalisation des analyses de RT-PCR, la société propose des systèmes entièrement automatisés permettant de répondre aux besoins de tous les laboratoires : plateforme d’extraction avec préparation de la PCR, automate compact pour des analyses en cartouche au coup par coup, système en plaque 96 puits entièrement automatisé depuis l’extraction jusqu’au rendu-résultat…
Parmi les nombreuses solutions de biologie moléculaire proposées par Biosapientia figure notamment le test ResistancePlus® MG, un test qPCR multiplex développé par la société SpeeDx (Sydney, Australie) pour la détection simultanée en un seul puits de Mycoplasma genitalium et de 5 mutations de résistance à l’azithromycine. Le 3 janvier 2023, Biosapientia signait un accord de distribution avec la société SpeeDx pour la commercialisation en France de l’ensemble de leurs solutions qPCR.
Franck Catteau, Président fondateur de Biosapientia : « Biosapientia est née de la volonté de 3 cadres ayant chacun plus de 20 ans d’expérience dans l’industrie du diagnostic in vitro de mettre leurs connaissances et leur savoir-faire au service de la biologie française. L’ADN de Biosapientia : la Sapience au service du patient ».
Thermo Fisher finalise l’acquisition de Binding Site au Royaume-Uni
L’américain Thermo Fisher Scientific Inc a finalisé l’acquisition de The Binding Site Group dans le cadre d’une transaction entièrement réalisée en numéraire, évaluée à 2,3 milliards de livres sterling, soit 2,8 milliards de dollars. Thermo Fisher avait annoncé l’accord d’acquisition du britannique le 31 octobre 2022.
The Binding Site fournit des tests de diagnostic spécialisés et des instruments pour améliorer le diagnostic et la gestion des cancers du sang et des troubles du système immunitaire. L’offre Freelite de The Binding Site est largement recommandée pour le diagnostic et le suivi du myélome multiple à tous les stades de la maladie par les principales publications de directives cliniques. The Binding Site compte plus de 1 200 employés dans le monde et fera partie du segment Specialty Diagnostics de Thermo Fisher.
« Nous sommes très heureux d’accueillir les collègues de The Binding Site au sein de Thermo Fisher Scientific », a déclaré Marc N. Casper, président, président et directeur général de Thermo Fisher. « The Binding Site élargit notre portefeuille existant de diagnostics spécialisés en y ajoutant une innovation pionnière en matière de diagnostic et de suivi du myélome multiple. Un diagnostic précoce et des décisions de traitement bien informées peuvent faire une différence significative dans les résultats des patients, et nous sommes enthousiasmés par l’opportunité de permettre de nouvelles avancées dans ce domaine pour le bénéfice des patients. »
Thermo Fisher Scientific
The Binding Site
Dendris, un concept unique d’assemblage de 3 technologies : BIO – NANO – INFO
Profil d’hybridation d’un échantillon contenant le pathogène Staphylococcus aureus
L’entreprise française Dendris développe, produit et commercialise une biotechnologie innovante en biologie moléculaire syndromique pour le diagnostic des maladies infectieuses bactériennes, virales et fongiques. Le concept de la technologie est basé sur un ensemble de PCR multiplex complexe (BIO) lue par une biopuce de 3e génération automatisée sur une plateforme d’hybridation.
L’originalité de la puce à ADN est double : elle est constituée par un revêtement nanochimique (NANO) par polymère tridimensionnel pour une densité et une accessibilité des sondes augmentées, et l’interprétation des résultats biologiques se fait grâce à un logiciel d’analyse des profils par Intelligence Artificielle (INFO). Ainsi on repère ce que l’on ne cherche pas et l’analyse de l’un bénéficie au résultat de l’autre.
En complémentarité de l’offre, Dendris a la particularité également de concevoir des puces à façon permettant de regrouper et d’automatiser les multiples PCR de base d’un laboratoire.
Une des ambitions de DENDRIS de par son savoir-faire et sa forte expertise est de créer un standard de la biologie moléculaire syndromique afin que le progrès puisse profiter au plus grand nombre.
Deux premières applications ont été mises au point et marquées CE :
• le dépistage des infections ostéoarticulaires (OA), avec la détection de 22 pathogènes et un marqueur de résistance à la Méticilline,
• la recherche des dermatophytes (DP) sur tous types de prélèvements utilisés en mycologie et écouvillonnage, détectant 12 pathogènes.
Deux kits de dépistage, ciblant respectivement les infections respiratoires et les mycoses profondes, sont également en cours de développement.
Dendris a pour objectif de proposer une biologie médicale accessible à tous, évolutive, flexible, adaptable, productive et économiquement compétitive sur une technologie de pointe pour une meilleure prise en charge des patients par les cliniciens.
Dépistage néonatal : 7 nouvelles pathologies et généralisation pour la drépanocytose
À la suite des recommandations 2020 de la HAS, 7 nouvelles maladies rares sont intégrées au programme national de dépistage néonatal en 2023.
• l’homocystinurie : anomalie concernant la vitamine B12 caractérisée par une anémie, une atteinte neurologique cérébrale et parfois un retard de développement ;
• la leucinose : maladie se caractérisant par des difficultés pour s’alimenter, un temps de sommeil trop prolongé, des vomissements puis des troubles neurologiques cérébraux et une insuffisance respiratoire en l’absence de traitement ;
• la tyrosinémie de type 1 qui atteint les reins et le foie ;
• l’acidurie isovalérique, responsable de troubles aigus à la naissance (vomissements, convulsions) ou de troubles plus tardifs (retard de croissance et/ou de développement) ;
• l’acidurie glutarique de type 1 qui entraîne des troubles neurologiques aigus chez les nourrissons ;
• le déficit en 3-hydroxyacyl-coenzyme A déshydrogénase des acides gras à chaîne longue, caractérisé par la survenue dans la petite enfance d’une hypoglycémie pouvant provoquer une atteinte au foie et une atteinte au cœur ;
• le déficit en captation de carnitine entraînant une atteinte cardiaque au début de l’enfance, souvent associée à une hypotonie, un retard de croissance, des crises hypoglycémiques récurrentes et/ou un coma.
Jusqu’à présent, étaient dépistés : la phénylcétonurie, l’hypothyroïdie congénitale, l’hyperplasie congénitale des surrénales, la mucoviscidose, le déficit en MCAD et éventuellement la drépanocytose pour les populations exposées. Le programme était complété par le dépistage de la surdité permanente néonatale.
Test drépanocytose généralisé
Depuis 2014, la drépanocytose faisait l’objet d’un dépistage ciblé, réservé aux bébés de parents originaires de régions à risque. Fin 2022, la HAS a finalement préconisé la généralisation de ce dépistage à l’ensemble des nouveau-nés au vu de l’incidence croissante de cette maladie depuis 2010 (557 cas en 2020 versus 412 en 2010). De plus, le dépistage est hétérogène d’une région à l’autre, avec le risque que certains nouveau-nés ne soient pas dépistés, en raison de difficultés dans l’applications des règles de ciblage.
VIDAL Sentinel intègre les données biologiques pour une meilleure sécurisation des prescriptions
La raison d’être de VIDAL est de contribuer au bon usage du médicament et à la qualité des soins. Afin d’éclairer leurs choix, VIDAL fournit aux acteurs de la santé la connaissance sur les produits de santé, la thérapeutique et la prise en charge, intégrée dans leurs outils quotidiens.
Le développement de la pharmacie clinique est un enjeu majeur pour les pharmaciens hospitaliers pour prévenir la iatrogénie médicamenteuse et répondre aux nouvelles missions des Pharmacies à Usage Intérieur (PUI). L’analyse des prescriptions hospitalières, étape essentielle du circuit du médicament, est complexe car elle nécessite pour le pharmacien la consultation de différentes interfaces au sein du Dossier Patient Informatisé.
VIDAL propose ainsi une solution numérique d’évaluation continue permettant aux pharmaciens hospitaliers de repérer les patients présentant une situation à risque iatrogène élevé, VIDAL Sentinel. Cette solution intègre et agrège les différentes données liées à la prescription médicamenteuse, aux données biologiques et au contexte patient.
L’apport des données biologiques telles que le débit de filtration glomérulaire, l’INR, les neutrophiles, permet ainsi aux pharmaciens d’affiner et optimiser leur analyse pharmaceutique. Elles contribuent également au suivi de l’évolution du risque iatrogène des patients tout au long de leur hospitalisation.
A partir de l’agrégation de ces différentes données et grâce à un corpus d’algorithmes élaborés à partir de données scientifiques, des retours terrain et d’intelligence artificielle, VIDAL Sentinel, analyse et priorise les dossiers des patients en temps réel par l’intermédiaire d’un score de risque défini pour chaque patient.
VIDAL Sentinel contribue ainsi à améliorer l’efficience des pharmacies à usage intérieur en priorisant les situations à risque et en optimisant la prise en charge thérapeutique.
La solution est aujourd’hui installée au sein du GHT du Var (CHI Toulon, CH de la Dracénie), au GHT Yvelines Nord (CHI Meulan les Mureaux) et au CHR de Metz-Thionville.
VIDAL Sentinel est un dispositif médical de classe I fabriqué par VIDAL France destiné aux professionnels de santé.
Antibiorésistance : l’écologie aussi importante que la consommation d’antibiotiques
Il est aujourd’hui primordial de comprendre les facteurs qui favorisent et orientent la propagation des gènes de résistance. Des scientifiques ont mené une étude sur les résistances aux aminoglycosides à l’échelle mondiale. La prescription de cette famille d’antibiotiques, introduite dans les années 40, a fortement décliné ces 30 dernières années, mais reste le dernier recours pour des infections bactériennes résistantes et est assez largement utilisée en médecine vétérinaire.
Des méthodes d’analyse génomique et de bioinformatique ont permis de générer une base de données répertoriant dans tous les génomes de bactéries disponibles la présence de gènes qui peuvent conférer une résistance aux aminoglycosides. Cette base de données contient pour chaque gène la famille à laquelle il appartient, l’isolat bactérien dans lequel il était présent, mais aussi les métadonnées associées, dont la localisation de chaque gène de résistance à l’intérieur du génome et en particulier s’il était associé à ou porté par un élément génétique mobile qui favorise les échanges horizontaux de matériel génétique entre bactéries d’espèces différentes.
Cette base de données fournit une description spatio-temporelle au niveau mondial de la répartition des gènes de résistance aux aminoglycosides, révélant que les résistances aux aminoglycosides sont ubiquitaires. De plus, on observe une coexistence pendant des décennies de plusieurs familles de gènes de résistance, plutôt qu’une succession, tant au niveau local qu’au niveau global. Cependant, si au fur et à mesure du temps, le nombre de façons de résister aux aminoglycosides augmente, la prévalence des bactéries résistantes aux antibiotiques stagne depuis les années 1990 au niveau mondial.
Quels facteurs d’expansion ?
Ensuite, des approches statistiques ont montré que la consommation humaine et vétérinaire d’aminoglycosides est un facteur qui contribue très peu à expliquer les variations de fréquence des résistances. En revanche, les flux de marchandises et de personnes et encore plus l’appartenance à un biome ou grand type d’écosystème sont des déterminants-clés de ces fréquences. De surcroît, l’équipe a inféré un réseau des transferts probables de résistances entre écosystèmes. Ce réseau suggère que les sols et la faune et la flore sauvage sont les écosystèmes-clés à surveiller pour prédire la circulation des résistances aux aminoglycosides.
Ces analyses ont donc permis d’établir à un niveau global que la sélection par les antibiotiques dans l’environnement est loin d’être la seule force évolutive qui conduit à la propagation et au maintien des résistances aux aminoglycosides. Cela suggère que les mesures de réduction d’usage des antibiotiques, clairement nécessaires, ne seront pas suffisantes pour aboutir à une diminution des fréquences des résistances aux aminoglycosides. Elles doivent absolument être couplées d’une part à des mesures de surveillance des bactéries et résistances associées aux importations, et d’autre part à des approches de description et de surveillance de l’ensemble des résistances présentes (le résistome), en particulier dans les écosystèmes-clés pour la circulation de ces résistances.
Enfin, la méthodologie de cette étude pourra être appliquée à d’autres familles de gènes de résistance et à d’autres échelles spatiales pour obtenir un panorama des fréquences de résistances et un diagnostic des facteurs qui expliquent leur circulation ou leur expansion.
PRADIER L et al., Ecology, more than antibiotics consumption, is the major predictor for the global distribution of aminoglycoside-modifying enzymes, eLife, 2023; doi:10.7554/eLife.77015
Découverte de biomarqueurs pour la myocardite associée aux IPCI
Les inhibiteurs de point de contrôle immunitaire (IPCI) ont révolutionné le traitement de diverses tumeurs malignes. Le développement et l’utilisation généralisée des IPCI ont permis d’améliorer les résultats avec un profil d’effets secondaires généralement mieux toléré par rapport aux autres thérapies.
Les effets indésirables des IPCI, bien que peu fréquents, sont le résultat direct de leur mécanisme d’action, la désinhibition des lymphocytes T entraînant une cascade complexe de dérégulation de l’auto-tolérance immunitaire qui peut survenir dans presque tous les systèmes organiques. La myocardite est la manifestation cardiovasculaire la plus grave, avec une incidence estimée de 1 à 2 %.
Une équipe de scientifiques médicaux internationaux dirigée par ceux de l’Université du Michigan a mené une étude de cohorte observationnelle de tous les patients adultes ayant reçu un traitement avec une IPCI simple ou double au Michigan Médecine entre juin 2014 et décembre 2021. Des tests en série pour l’aspartate aminotransférase (AST) et l’alanine aminotransférase (ALT), la créatine phosphokinase (CPK) et la lactate déshydrogénase pendant le traitement IPCI ont été effectués sur une base hebdomadaire chez tous les patients pendant toute la durée du traitement IPCI.
Au total, 2 606 patients adultes ont reçu au moins une dose d’IPCI entre juin 2014 et décembre 2021. 27 d’entre eux, soit 0,14 cas pour 10 000 personnes-années, avaient un diagnostic de myocardite attribué au traitement par IPCI, dont cinq cas ont été classés comme certains, quatre comme probables et 18 comme possibles. Le nombre total de patients ayant reçu un traitement IPCI et l’incidence de la myocardite IPCI ont augmenté régulièrement entre 2014 et 2021.
L’équipe a rapporté qu’au moment du diagnostic, les patients atteints de myocardite présentaient des taux élevés pour la troponine T haute sensibilité (100 %), ALT (88,9 %), AST (85,2 %), CPK (88,9 %) et la lactate déshydrogénase (92,6 %). Au total, 95 % des patients atteints de myocardite IPCI présentaient des élévations d’au moins trois biomarqueurs, contre 5 % des patients sans myocardite. Parmi les biomarqueurs non cardiaques, seule la CPK était associée au développement d’une myocardite et à la mortalité toutes causes confondues. Les élévations de CPK avaient une sensibilité de 99 % et une spécificité de 23 % pour identifier la myocardite.
Les auteurs ont conclu que bien que son incidence soit rare, la myocardite IPCI est associée à de mauvais résultats. Ainsi, l’identification des patients atteints de myocardite est cruciale pour fournir une intervention et un traitement précoces. La myocardite aiguë IPCI coexiste avec d’autres effets secondaires. Ainsi, une élévation de l’AST, de l’ALT et de la CPK les trois premiers mois de traitement par IPCI devrait inciter à une évaluation plus approfondie de la myocardite IPCI, et des taux normaux de ces biomarqueurs pourraient exclure une myocardite aiguë IPCI.
VASBINDER A et al., Biomarker Trends, Incidence, and Outcomes of Immune Checkpoint Inhibitor–Induced Myocarditis, J Am Coll Cardiol CardioOnc, 2022; 4(5):689-700
MANIFESTATIONS
Retrouvez dans Spectra Diagnostic N°25 :
BOURSE & BIOTECHS
Les nano-caps ont le vent en poupe outre-Atlantique
Riccardo VIOLA, Carine ALLOUNAN, Arsia AMIR-ASLANI
INTERVIEW
Ségur du numérique et biologie médicale : la question du Transcodage LOINC
Dr Guilhem Mayoral, Président et Directeur Médical d’Onaos
TECHNOLOGIE APPLIQUÉE
Les systèmes d’information pour laboratoires de biologie médicale en 2023
ÉVALUATION
Exploration biologique des allergies : mise en place et qualification de l’automate Noveos™ Hycor Biomedical Inc pour le dosage des IgE spécifiques d’allergènes
Juliette CHARPY, Miranda LAUX, Caroline KLINGEBIEL, Pol André APOIL, Julien GORET
MISE À JOUR DES CONNAISSANCES
La résistance aux antibiotiques : comprendre les principaux mécanismes de défense des bactéries pour prévenir l’émergence de « super-bactéries »
Philippe KAHN
